鹅子
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最近动态

2019-08-07 16:55 回答问题

根据计算的TOM值自己排下序就可以了

2018-12-11 10:05 回答问题

3基因按照固定的顺序拼接后,用MGEA不行吗?

2018-09-26 14:32 回答问题

无图无真相,得有图片或者数据才能说明问题啊

2018-09-19 11:43 回答问题

应该是文件名称的问题,样品名之间是用了空格分开的吧?你检查一下 1、修改样品名 2、或修改读取代码 read.table(sep="\t") 添加一个分隔参数

2018-09-19 11:08 回答问题

应该是模块内所有点和hub对应的 Ki 以及这些点和性状的GS 吧,如此才可能能构成两列的二维数据,从而在图上构成散点图???没仔细看论文,猜测是这样的

2018-09-14 09:21 回答问题

课程中并未涉及这部分内容,KME的计算过程可以参考文章:http://www.omicsclass.com/article/381 

2018-09-12 18:13 回答问题

1、先认R2 2、就你的数据 计算power值已经到32,数据经过32次幂对应的网络会使得连通性很小,这样得到的网络很难得到hub基因 3、总的而言,对应的数据并不是很适合进行分析,即使分析获得结果可靠性也不高

2018-09-12 11:36 回答问题

1、如果不确定可以通过查看二者的结果是否有明显的差别 2、第一个代码是分步,选定power后: datExp---adjaceny--TOM--dissTOM过程,第二个是直接由选定power:datExp——dissTOM 理论上一个分步,一个一步,涉及的背景理论和算法应该一致,具体通过结果查看是否存在明显区别即可。

2018-09-07 15:58 回答问题

附件上传一下原始数据吧,这样才能看出来错误

2018-09-06 18:07 回答问题

可以的,这种估计结果有的时候回明显不对,譬如1的情况,可以按照需求自己判断取一个相近的R2值对应的beta去进行下一步计算