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gatgatk硬过滤的时候 --filter-expression "QD < 2.0 || MQ < 40.0 || FS > 60.0 || SOR > 3.0 || MQRankSum < -12.5 || ReadPosRankSum < -8.0" --filter-name 'SNP_filter' -O all.filter.snp.vcf.gz --cluster-window-size 5 --cluster-size

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基因家族分析-基因结构

  • nuli 2024-01-07 14:56
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基因家族建树

  • nuli 2024-01-07 10:10
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SNP过滤de问题

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在使用gapit完成gwas分析后，出图时出现如下错误，输出的图只有坐标轴

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3 在进行structure分析时，我按照步骤一直做，然后做图那步骤时候，显示没有这个输入文件，想问问问题出在哪里？

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如何合并两个提取好的两个保守结构域的序列

  • nuli 2024-01-06 11:27
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一个酶基因家族里边具有两个结构域

  • nuli 2024-01-06 09:12
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在gwas分析制作进化树时，出现如下报错

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从NCBI上下载的注释文件在进行叶绿体比较基因组分析，例如IR边界分析时，是否需要先人工校正

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pfam选择

  • nuli 2024-01-05 16:45
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请问用相同的文件，只是把名字改了一下，然后docker自动把重复的序列删除后，为什么出来的motif不一样啊

  • 李 2024-01-05 15:36
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为什么找不到如下路径呢？？CAFE软件如何安装？

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hummersearch命令出错-2

  • nuli 2024-01-05 11:57
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基因家族鉴定数据准备

  • nuli 2024-01-05 11:47
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hmmersearch命令出错

  • nuli 2024-01-05 10:42
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注释完绘图出现报错信息

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docker 基因家族鉴定提取CDS序列 命令报错

  • nuli 2024-01-04 20:37
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在构建进化树的时候，发现分组与拟南芥中的不同，比如A4分组被分开了，请问有什么解决方法吗？老师我看到了这个问题您回答说调整多序列比对结果，具体是怎么调整呢？

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有2个问题想请问老师，1基因名字字体过大，如何调整字体，2进化树分支线太短，看不清楚，如何将线拉长