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我在call snp,使用GATK导入db,得到的结果中没有callset.json文件，我一共15条染色体，db文件夹里只有两个染色体的文件夹内容，麻烦老师解答

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进化树构建

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GWAS脚本中的$PATH为什么脚本运行会报错

  • Jay 2024-03-19 21:28
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请问，利用Linux制作circos配置文件时，result文件无数据是什么原因

  • LWX 2024-03-19 16:58
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请问nextpolish运行报错，run.cfg文件和报错信息如图，麻烦老师看下，谢谢！

  • 荣 2024-03-19 16:54
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5 请问如何合并VCF文件中同一样本的生物学重复信息

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使用tassel软件对vcf文件排序时出现ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - java.lang.IllegalArgumentException: AlleleDepthUtil: depthIntToByte: Can not have negative depth values: -8448

  • mike 2024-03-18 18:42
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使用tassel软件对vcf文件排序时出现ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - java.lang.IllegalArgumentException: AlleleDepthUtil: depthIntToByte: Can not have negative depth values: -8448

  • mike 2024-03-18 16:27
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在基因家族分析时，保留编码蛋白基因命令时出现 bash :agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl : command not found

  • Lu 2024-03-18 15:52
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10 在无参转录组中，如果之前有人鉴定过某一物种的转录组并为相关基因命名了，后人要沿用吗

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一个家族基因隐马尔科夫模型

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LDBlock绘制局部曼哈顿图的时候，我想加入目标区段多个环境SNP检测到的P值，请问数据格式是什么谢谢

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老师，我分析的物种是6倍体，参数需要变动嘛？

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5 在使用Gepard时出现了这样的图，与教程中的不一样，请问是哪里除了问题，如何改正？

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单倍型分析中最后一步失败，麻烦老师

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老师好 plink分析pca 一直报错

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老师换了新的config3.txt，但是只出来了svg格式的图，没有png格式的图，而且出来的图不对，没有连线，空空如也。

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在circos绘图时，最后一步不出图，显示出错误

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非模式物种建库进行GO和KEGG富集分析

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使用GATK的GenomicsDBImport合并gvcf导入db时报错Unexpected compressed block length: 1 for /work/GATK/BN14.g.vcf.gz