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关于mcscan的问题

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无参转录组怎么分析？

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GO层级整理

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基因家族在求串联复制是，是自己写perl 脚本根据在染色体上距离不超过200kb来计算，还是要MCScanx的计算结果好呢？

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基于R语言开发的软件包存放在哪里？

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无参转录组比对达到多少。认可为相应基因？

  • yc 2019-09-28 16:07
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您好，我在数据库中搜索到了某个物种基因组测序的SRA序列，但没有注释。请问，我可以把它下载下来，就某一个基因家族序列进行注释吗？

  • yc 2019-09-28 16:06
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Trimmomatic软件可不可以去除hiseq4000的接头

  • 2019-09-28 14:42
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你好，我想问一下，为什么分染色体提取的序列有的能全部提取到，有的只能提取到一条？谢谢！老师您好，您看看这个输入文件，是不是有问题？谢谢

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老师，你好。在做有参转录组分析，转录本基因表达量出来之后，发现里面找不到我期待的同源基因（ID)，不过里面发现了好多MSTRG.这样的ID，问题是这些ID在我的注释文件里根本没有，详细情况如下

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为什么用KEGG mapper作图pathway 没有呢？

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5 WGCNA运行代码问题sft

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illumina芯片矫正

  • Alex 2019-09-26 23:02
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基因家族分析circos里的colline_v2.pl脚本输出文件都是0怎么解决？

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您这里的课程筛选串联重复基因的标准是参照这篇文献的extent of gene duplication in the genomes of Drosophila,nematode ,and yeast(2002). Mol Biol Evol。 这篇文献是用的果蝇，线虫，和酵母菌的，可我做的是植物，我还可以用这种方法吗

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mapman非模式作物基因注释

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10 大佬们，想咨询个问题，如何从公司测回来的转录组数据找出自己想要的某个功能的差异基因呀？

  • 2019-09-26 14:19
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10 eclipse 安装好了，也打开了，不过安装不了Perl和pydev.既不显示，也下载不了

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请问老师转录因子数据库，PlantTFDB为撒进不去啊，撒原因

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5 转录组的差异基因的注释