老师,您好,我在16S数据实操中的qiime聚类生成otu的第一个方法中操作 pick_de_novo_otus.py 这一步,缺少了很多文件,之后我又单独操作的,在操作第三步 # Assign taxonomy command 时,没有出现qiime_rep_set_tax_assignments.txt 这个文件,第四步也没有办法操作,是哪里出问题了呢

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2 个回答

小野猫
方法二和三也运行不了,脚本所在的目录已经添加到了环境中了(T_T)
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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

电脑内存不够,系统自动杀死了进程;

建议至少16G以上的内存才可以运行, 。

docker  中内存调整:https://www.omicsclass.com/article/1413

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  • 小野猫 提出于 2021-01-10 19:52

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