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3 求助：建库的时候显示 fa 文件不存在

  • 2020-04-30 14:06
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5 请问关于转录本拼接整合的问题

  • dd 2020-04-29 09:28
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5 做基因组间共线性时用下面这个命令进行过滤，我想问一下这个命令在写文章的时候怎么描述呢？

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3 结构域建树

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5 老师能不能写一下用咱的虚拟机使用orthofinder

1 解决

18 在R中进行差异表达分析，运行GDCdownload(query = query, directory = DataDirectory,files.per.chunk=6, method='client')代码时，数据下载失败，并显示如下错误

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5 bootstrap consensus tree导出nwk文件格式时Branch_lengths选项无法选择

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5 segentation fault

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10 GEO数据库下载的表达矩阵转换成genesymbol时报错。perl脚本。请问perl脚本的问题出在哪？需要怎么修改。最后有perl及需要处理的数据的百度云链接（链接：https://pan.baidu.com/s/1fKim1pGNsU4DDJXcxchplg 提取码：5ls1）

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10 GEO数据库下载的表达矩阵转换成genesymbol时报错。perl脚本。请问perl脚本的问题出在哪？需要怎么修改。最后有perl及需要处理的数据的百度云链接（链接：https://pan.baidu.com/s/1fKim1pGNsU4DDJXcxchplg 提取码：5ls1）

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20 老师，请问做基因上游顺式元件分析时，只有cds文件，gff文件和pep文件，该怎么提取promoter序列

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10 老师，想请问一下，Kaks_caculator在linux中怎么安装，有没有软件资源

  • 2020-04-18 09:37
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20 老师，请问做基因上游顺式元件分析时，只有cds文件，gff文件和pep文件，该如何提取promoter序列

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10 老师，请问只有gff文件，cds文件和pep文件，该如何做基因上游顺式元件分析

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100 如何提取一个冷门物种（NCBI下载）的CDS序列

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10 老师你好，最近我在使用tbtool的blast时发生报错

  • LGC 2020-04-15 03:10
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20 NCBI的数据库更新了，两份数据文件用哪个？

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10 请问老师有没有get_gene_position.pl，get_gene_bed.pl，get_fa_by_id_from_bed.pl这个三个脚本的下载地址？

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10 老师您好，我想请问一下我用GSDS做顺式作用元件图时，提交结果只显示CDS的长度，并没有顺式作用元件，查看了基因ID也是对应的，且提交的时候并没有提示文件格式有误。请问这个情况如何解决

2 解决

10 老师您好，请问plantcare软件预测出来的顺式作用元件进行筛选绘图的时候需要区分正负链么，是只选择其一呢，还是都选？