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请问老师用McscanX做基因组内共线性分析,在准备family.ctl文件时,对染色体编号有撒要求没,我的染色体编号中还有chrA01,chrC01,以及chrA01_random,以及 chrAnn_random,我看有人说染色体编号只能有2个字母加数字,谢谢!
。。。。。
2020-03-02 13:22
1
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1807
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老师,做基因组内共共共线性分析出现这种错误的原因是撒原因?
。。。。。
2020-03-02 11:35
1
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2822
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老师,我在做hummer搜索时,输入hmmsearch --domtblout ACTS_hmm_out.txt --cut_tc ACTS.hmm proteins.fasta后,
苦行僧
2020-03-01 16:06
1
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3188
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5
老师您好,我想请问一下,通过分析找到的基因家族成员在NCBI上都是预测基因,继续分析没有问题吗
NCBI
基因家族
可乐加冰
2020-02-28 23:18
1
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5483
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基因家族分析已经确定是哪个家族之后,找不到pfam号该怎么办?
pfam
可乐加冰
2020-02-28 20:33
1
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3011
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保守结构域进化树
Li
2020-02-28 00:16
0
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1698
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bio-linux中用hmmsearch遇到问题
hmmsearch
稚生,
2020-02-26 20:43
1
回答
2782
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重新挂载显示不出文件
挂载
biolinux
Li
2020-02-26 10:19
1
回答
3677
浏览
请问老师2个基因家族得ID怎么在一个共线性绘图里面表示出来,就像这样得图。
共线性分析
守得云开雾现。
2020-02-25 23:09
2
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3686
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10
老师我想问一下用circos绘制基因组内共线性图时,config2.txt文件中的目标基因link.txt部分怎么更改才能使目标基因在图上的字体放大并且设置斜体?如下图:
circos图配置文件
Circos
pf2139
2020-02-23 21:54
1
回答
2354
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比较基因组学报错,如下图
python版mcscan
MCScanX
dec.
2020-02-23 19:31
1
解决
3175
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mcscan作图时,染色体片段比较小,显示不出来怎么办??请教
python版mcscan
MCScanX
余生
2020-02-23 19:04
1
解决
2581
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5
mcscan_layout参数都是有关什么呢?求教
python版mcscan
MCScanX
余生
2020-02-23 18:52
1
回答
2176
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老师,您好!我在进行基因家族的分析时,在利用.aln文件获得新的hmm文件后,利用新的hmm进行hmmsearch,得到的新的domain.txt中我的目的基因的E-value的值已经达到2.2,是不是可以说明我的目的基因不属于我现在分析的这个家族?
hmmsearch
hmmer
笨&奔
2020-02-22 17:53
1
回答
4079
浏览
请问老师我在MAFFT上构建进化树,结果是This is a Neighbour-joining tree without distance corrections。
进化树
MEGA
守得云开雾现。
2020-02-21 19:35
3
回答
2594
浏览
请问老师基因家族单纯的只做视频那一套+荧光定量,能发sci吗?不加转录组。3区的
守得云开雾现。
2020-02-16 17:57
3
回答
3850
浏览
请问老师我下载了根,茎,叶,花,种子的转录组数据,怎么做成基因家族热图形式。
守得云开雾现。
2020-02-16 15:19
1
回答
1539
浏览
请问老师,我做油菜的一个基因家族,共线性分析没有加倍的基因,发文章会有影响码?
守得云开雾现。
2020-02-15 20:27
1
回答
3885
浏览
基因组间的共线性分析为什么要对共线性区域进行过滤?
共线性分析
python版mcscan
Maggie
2020-02-15 19:44
1
回答
3226
浏览
10
在运用Linux系统命令,KA/KS,计算重复串联基因时,出现的duplication_gene文件,有点问题
Ka/Ks
blast
kaikai
2020-02-15 18:07
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