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请问老师,基因家族里面筛选到很多对重复基因,那么kaks计算只能一对一对进行吗?准备文件也要一对一对分开准备吗?我把所有重复基因的序列号全部沾到dupid里面是不是不行的?上课的例子只筛选到了一对WRKY基因。谢谢解答。
KaKs
LILA
2019-06-13 00:16
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MCscan运行问题:ZeroDivisionError: float division by zero
python版mcscan
MCScanX
兰天
2019-06-12 12:43
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问下在做基因家族进化树时,建的树bootstrap好多为0,这对发文章数据影响吗?还有要怎么分析解释呢
空空
2019-06-07 19:50
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老师好!做比较基因组分析时/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH OEH --cscore=0.7 报错
STAND BY ME
2019-06-03 15:29
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章节1课时6,获取蛋白质序列以及提取1.5kb的DNA序列之前时总是不对,全是~~~~~~一行一个,不知道问题出在了哪里。还望有知道的能指点下。如下图
基因家族
正阳春明
2019-05-30 03:52
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按照课程中用MEGA建树时,一直建不成功
MEGA
tree
空空
2019-05-29 10:43
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5
如果做想做基因家族分析,需要依据哪些基本原则?
基因家族
2019-05-24 15:53
1
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10
求助,如何获取基因与mRNA的对应关系?
TonY
2019-05-23 16:16
2
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2808
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5
用hmmer提取物种结构域时,结构域文件是空的
琳lin
2019-05-23 14:25
1
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5
请问一下,自己找关于基因家族分析的课题有什么注意事项,找家族基因有什么要求?怎样防止和别的文章研究的家族基因相同?
[玺]
2019-05-21 21:07
1
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5
手动确认NBS结构域时,在SMRT确认的含NBS结构域的基因数目与已发表文献中的不符
NBS
杨辉
2019-05-17 22:44
2
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10
请问老师,我看基因家族分析视频中基因定位染色体用的拟南芥的DNA文件,我做的植物,没有DNA这个文件,可以用其他文件做吗?
DNA
守得云开雾现。
2019-05-17 19:49
1
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5
比较基因组绘图时报错
比较基因组
吹不成调
2019-05-15 11:44
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circos基因加倍分析最后一步报错
Circos
吹不成调
2019-05-13 20:28
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5
老师,我在基因家族鉴定时,用新生成的hmm文件做hmmsearch时,报TC bit thresholds unavailable on model domain的错误。最开始以为是e值太高1e-5,但我后面改为1e-10还是报这个错误。请问老师是什么原因呢?
旗旗
2019-05-10 10:55
1
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5
老师请问gff文件提前mRNA的id不是数字,是字母,是不是脚本需要换?
GFF
守得云开雾现。
2019-05-07 21:22
1
解决
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5
MCSCAN
mcscan报错
.,,.,.,.
2019-05-06 11:07
1
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5
我用MCScanX做共线性分析,染色体出现重叠现象,请问MCScanX做共线性分析限制染色体条数吗,我有22条染色体
MCScanX
2019-05-05 08:51
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做基因家族成员鉴定时,如何从NCBI数据库里下载转录组unigene的蛋白质序列文件?
旗旗
2019-04-29 14:56
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比较基因组学分析共线性中 No module named jcvi.compara
。翟
2019-04-28 21:31
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