老师您好，我线下上过您的基因家族培训课程，目前在尝试用大豆基因组进行分析，但我发现从ENSEMBLEPLANT下载的基因组序列格式跟拟南芥的注释格式不一样，我已经尝试着进行了一些编辑，但还是无法统一ID，麻烦您帮我解决一下这种基因组注释格式修改问题

10 老师您好，我线下上过您的基因家族培训课程，目前在尝试用大豆基因组进行分析，但我发现从ENSEMBLEPLANT下载的基因组序列格式跟拟南芥的注释格式不一样，我已经尝试着进行了一些编辑，但还是无法统一ID，麻烦您帮我解决一下这种基因组注释格式修改问题

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下面这几个文件是从ensembleplant 网站下载的，Glycine_max.Glycine_max_v2.1.43.chr.gff3 ， Glycine_max.Glycine_max_v2.1.cds.all.fa ， Glycine_max.Glycine_max_v2.1.pep.all.fa ，格式信息如截图所示（我在基因家族培训QQ群里发布的那张图是我自己尝试编辑修改后的）,期待您的帮助，非常感谢！

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分类：基因家族分析

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omicsgene - 生物信息 2019-07-22 10:10

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

首先把 gene:等修改一下，然后根据下面生成的转录本ID与基因ID对应关系，通过excel 中Vlookup 查找对应关系；

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