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老师，我在构建泛基因列表时，做cat pangene_filter.*lifted.anchors | grep -v "^#" | awk '{print $1"\t"$2}'> ../03.jcvi-pan-vs-genome/syn.txt这一步，找不到pangene_filter.*lifted.anchors 是怎么回事

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老师，我正在做泛基因家族分析的系统发育树构建，构树过程中，出现以下的过程及警告，请老师帮忙看看是否正常，这些重新序列的编号是否有影响（序列对其修剪后有重复名称已去除），以及我下面的系统发育树这么多是否正常，还是需要筛掉一些？

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3 老师，在泛基因列表构建时，总共113个基因组，成功提取了最长转录本，提取bed文件，但提取cds文件时，有一个文件A10总是失败，不知道什么原因。

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泛基因集构建中JCVI做共线性分析构建完一半数据报错 core dumped

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第一张图片为smart，没有查询到结构域。第二张图片为interpro，共有135条序列，最后显示结果为118。图3为CDsearch查询结果，为135条。最终形成的新的IDlist是不是以interpro为准，118个ID

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docker连接不上

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想问一下视频课程里的data内容换成自己的数据就行了嘛？

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运行hmmsearch返回结果为空，后来再试时报错

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从结构变异注释文件中提取WRKY基因结构变异信息

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老师，您好，我正在泛基因家族分析，想问课程中用到的结构变异的vcf文件all_merge.vcf是泛基因组全基因组范围的变异吗，

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泛基因家族，典型基因和非典型基因的热图怎么做？

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老师，我正在做泛基因家族分析的结构变异与基因注释部分，出现一些错误

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老师您好，我正在做泛基因家族分析中，家族成员存在缺失分析，需要准备泛基因组列表，前面通过学习咱们得泛基因集构建课程，生成了 final.last.gene.pair.txt 文件，整理格式之后不正确

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老师我做存在缺失分析部分，Fam_gene.list中泛基因编号为什么不是连续的呢

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泛基因家族分析

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有两个基因不在染色体上在contig上，为什么会这样，图片里的contig可以删掉吗，会有什么影响吗

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老师，在泛基因家族分析结构变异的基因注释中，提取vcf文件有用信息列，$14是哪个

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vcf文件如何合并

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基因家族生信

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36 泛基因家族分析之Fam_gene.list