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请问在做SSR分析用circos,会显示配置文件报错要怎么解决呢，完全粘贴课程内容中的conf配置文件

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服务器putty上可以进行内存设定和线程设定吗？我按照基因家族环境分析环境搭建ppt上，对内存和线程进行设定，但是在putty上运行不了。

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老师，您好，我在运行gatk的HaplotypeCaller时主脚本通过 SLURM 调度系统提交作业，使用 GNU Parallel 并行处理多个样本并调用 HaplotypeCaller 脚本，目前运行了约六七个小时，我的工作日志.err和.out都为空这是正常的吗？

  • Geő 2025-05-14 17:06
2 解决

基因ID

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我的fasta文件是由scaffold组成的，不是直接的A01和C01之类的，然后我现在用现有的文件以Gapit方式跑曼哈顿图时报错，该怎么调整

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宏基因组分析老师上课的内容。

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老师请问，怎么把这些文件像您一样做成一个文件在数据库里确认结构域

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下载HMM模型

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终端没反应

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circos绘图

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进化树+motif+基因结构三个一起显示报错

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perl $scriptdir/vcf2hmp.pl all_clean.vcf.gz hapmap.txt.gz始终显示找不到脚本，但脚本在我设置的路径中，不知道该怎么解决

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服务器超过5个线程，被killed。请问怎么使用名单规定线程？下面命令如何修改规定线程。

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老师，为什么我把data数据链接过来的时候链接不过来，会出现这样页面？

  • 2025-03-07 09:30
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老师，请问分析fasta格式的文件需要全部转成gff格式再分析吗？

  • 2025-02-26 23:00
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老师上课的内容，为什么我的demo里面没有东西？

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Arabidopsis_thaliana.TAIR10.56.gff3.gz 课程资料发我的gff文件里面没有parent信息，影响基因家族分析吗？

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Error response from daemon: Get "https://index.docker.io/v1/search?q=omicsclass&n=25": dialing index.docker.io:443 container via direct connection because has no HTTPS proxy: connecting to index.dock这是

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老师，我研究的植物有人已经构建了泛基因组，用的从头组装比对的方式，我想问一下，如何利用他的数据做我的研究，我可以添加几个自己的物种进去吗，请老师给个研究思路

  • Oho 2025-03-27 10:25
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老师您好，做染色体水平基因组组装与注释，没做核型分析，可以推测染色体条数吗