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EMMAX进行GWAS分析时候出现问题

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你好老师为什么这里无法启动镜像

  • Nier 2025-12-27 18:23
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今天下午docker突然不能用了是什么原因？？

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基于图形泛基因组文件call取sv的时候，运行命令nohup vg call new_index.giraffe.gbz -r new_index.snarls -k D23.pack -a -A -t 30 -s D23 > D23.vcf 2>call.o &，显示done，但生成的vcf文件里面没有变异位点，只有个头，如截图中所示。这种问题怎么解决呢？

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在用GEMMA软件进行GWAS分析的时候，需要加入Q矩阵，有一个疑问

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泛基因家族做完PAV分析后，发现有的物种没有任何一个基因

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重测序过滤

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之前用的咱们的docker今天突然不能用了，是什么原因？

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老师，我想把镜像复制到自己服务器上使用，使用的是singularity run reseq.sif，为何进入容器以后软件都用不了呢，是哪里出了问题？

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10 您好，请问SNPT软件失效了

  • cc 2025-12-31 16:09
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泛基因家族分析，核心基因等数量统计

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但我后面加了$之后它先是报错没有index目录，创建之后运行不报错但没有运行结果

  • xxx 2026-01-06 14:41
3 解决

我更改文件名之后还是会复制不成功，这条命令应该怎样更改才正确，位置路径在R中显示是home/gene/genome

  • xxx 2026-01-04 15:37
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连接镜像被拒绝

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泛基因组

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为什么这两次是一个文件，只是改变了核数，输出的结果却不一样了

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泛基因组基因家族_PAV分析，核心和可变基因富集分析问题

  • Oho 2025-12-25 09:56
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建立索引时出现报错，但依旧出现了一些文件，想问问报错原因怎么处理

  • xxx 2026-01-07 15:24
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nucmer比对出现问题，导致部分样本没有结果

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想知道sh scriptdir/index.sh怎么创建才能用于索引建立，输入指令显示不存在

  • xxx 2026-01-06 10:38