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组内共线性分析，为什么不能出图呢？

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您好iqtree2运行的时候报错，“You should increase checkpoint interval from the default 60 seconds”，请问可能是什么问题呢？docker虚拟机CPU：16 core，Memory：64 GB。谢谢！

  • 2025-07-05 22:26
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你好，提取CDS序列时，出现错误，怎么解决

  • 2025-04-01 14:33
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老师，这是我做出来的PAV热图，每个基因都是物种独有的，这个PAV热图效果是不是不好，这个PHY家族是否合适继续研究，没办法做聚类分析这些了

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老师，这是我的gene.list和其他文件的基因，不是只有一个，而且也能对上，但是做domaindomain_final.bed的时候就只有一个基因，我试了WRKY和FAE1这两个家族，都会出现这种情况

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您好，请问您paircoil2安装问题解决了吗，我安装也出现了和您类似的问题，我也按照那个文件要求把配置文件放在家目录下，但是仍然命令使用不了，网上实在搜索不到相关信息，只能请问您了，望回复

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进行ka ks分析报错

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老师你好。提取cds与pep序列报错显示 no sequence

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老师 就是我在做比较基因分析的时候生成的bed文件是空的 这是什么问题呀

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蛋白3D结构预测

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Te amo老师 就是 我在做共线性分析哪里，遇到下面这个问题，就是遇到生成的*.axt文件是空的，然后报错我截屏在下面啦，您帮我看一下嘛 谢谢，上面的那个问题我已经解决啦。

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泛基因家族分析

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老师，我要做泛基因家族分析中泛基因列表构建，我是不是只需要把data数据的基因组和gff文件链接过去，不用再建文件夹下载了，然后一步步做Rstudio的操作么，我需要下载pangenlist里面的哪些文件到自己的服务器？

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windows安装Aspera Connect软件

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Error correction and assembling warnings: * 0:12:28.935 6768M / 13G WARN General (kmer_coverage_model.cpp : 327) Valley value was estimated improperly, reset to 16

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蛋白3D结构预测

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老师，我做PAV分析时，“提取物种间泛基因编号相同的基因为同一基因”，这一步时产生的“maize.PHYgene.pan-genes.list”，只有几个基因，其他文件都正常，这是怎么回事

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为挂载到染色体上的基因家族成员能否绘制基因在染色体上的定位图？

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使用lordec 利用二代数据校正三代数据

  • yy 2025-02-26 10:53
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Error, no sequence for chr1 at xxxxxxxxxxxxxxx/util/gff3_file_to_proteins.pl line 82.