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老师，想问一下我泛基因集构建生成的last.gene.pair.txt文件是乱的，这个怎么办呢？应该怎么统一一下呢？

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老师，在泛基因集构建时JCVI的比对，出现以下错误

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老师，我的基因组有113个，今天运行整理泛基因集列表中共线性分析生成pangene.bed和pangene.cds那一步，已经运行了18个小时了，才运行到79个基因组，其他步骤也是，比较慢，有没有快一点的方法呢？与网络有关系吗，换一个快的网线能加快进度吗？或者有没有其他命令可以加快。

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3 请问，在3个数据库中进行结构域确认时，为什么我出不来和老师一样的结果，是不是使用的_pep_need_to_confirm.fa文件里面基因名称一行需要修改？

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RNAseq有参转录组分析差异表达分析这一环节出现一些问题，ggplot版本问题

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老师，就是我在做结构变异分析那里，我重测序分析的个体只有36个 下面我用红色箭头指的那个参数和值为30的这两个参数设置为多少比较合适呀，谢谢老师

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GWAS分析的问题

  • John 2025-03-10 15:36
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提取VCF 文件里的SNP

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重测序

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您好，想和您咨询一下，我用土壤样本测微生物宏基因组注释，40个样本，一共500g左右，想和您咨询一下，一定要用服务器吗，普通电脑96g运行内存有可能注释出来吗，感谢感谢

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老师，请问泛基因家族成员鉴定中，hmmer结构域搜索；；我有两个结构域，而hmmersearch一次只能筛选一个结构域；请问如何筛选同时含有两个结构域的呢；请问这两条指令如何修改？

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老师，在泛基因家族分析，我提取最长转录本时输出的gff文件是空的，能帮我看一下为什么吗

  • aa1 2025-01-06 09:35
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docker search 出现错误是怎么回事

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10 重启后还是没有Hyper-V选项，是什么原因导致的呢

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老师，这个done之后不动了，开始运行了吗？如何判断呢？

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IBD 计算2

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QTL定位时像小麦染色体为chr1A-7A,chr1B-7B,chr1D-7D,代码应该怎么修改？

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老师，在使用gemma模型的时候，报这个错是为什么呀

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老师，构建泛基因列表使用的vcf文件，是下面图中的sv数据吗，下面表格包括了CHROM，POS，REF，ALT，TYPE，MAF,MIS，ANN，将这些数据整理成vcf吗？

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新安装docker desktop为什么显示docker engine stopped