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perl $scriptdir/vcf2hmp.pl all_clean.vcf.gz hapmap.txt.gz始终显示找不到脚本，但脚本在我设置的路径中，不知道该怎么解决

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string数据库

  • 2025-05-28 09:09
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run_pipeline.pl -Xmx5G -importGuess clean.sorted.vcf.gz \ -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter这条代码跑不出来，报错原因如图所示，

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我用gemma做小麦的gwas分析，到最后一步生成曼哈顿图时出错，是因为参考基因组的染色体编号与基因型数据对应不上吗，应该怎么老师解答

  • 2025-07-10 03:28
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服务器putty上可以进行内存设定和线程设定吗？我按照基因家族环境分析环境搭建ppt上，对内存和线程进行设定，但是在putty上运行不了。

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老师，保留最长转录本中，过程文件出现了take into account

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请问在做SSR分析用circos,会显示配置文件报错要怎么解决呢，完全粘贴课程内容中的conf配置文件

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泛基因家族分析

  • 2025-07-28 09:44
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服务器超过5个线程，被killed。请问怎么使用名单规定线程？下面命令如何修改规定线程。

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老师这个示例文件夹里没有东西，我cd到01.prepare_data文件夹下里面时候空的

  • Oho 2025-03-09 11:43
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请问老师，泛基因家族鉴定开始做自己的物种时，怎么在docker 里上传自己需要做的物种的数据

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我想问一下在进行WGD分析时，要算复制时间，基于物种进化速率的公式：The divergent time of the whole-genome triplication (WGT) event was calculated using the formula divergence dateKs / 2r.

  • jpq 2025-05-26 15:37
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不同物种之间的共线性分析，出现问题，望解答、谢谢

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为什么启动镜像时总是出现这样的报错啊老师

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treemix分析

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老师，这是我做提取可靠基因家族成员的结构域序列用到的文件和代码，不知道哪里除了问题导致domain_final.bed只有一个基因

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请老师帮忙解答，运行的构建泛基因组图谱的代码，生成的文件比视频中少很多

  • Oho 2025-04-27 12:19
2 解决

蛋白3D结构预测

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Te amo老师 就是 我在做共线性分析哪里，遇到下面这个问题，就是遇到生成的*.axt文件是空的，然后报错我截屏在下面啦，您帮我看一下嘛 谢谢，上面的那个问题我已经解决啦。

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老师上课的内容，为什么我的demo里面没有东西？