这个是比较正常的。13条染色体中包含了大量的小染色体，这些小染色体由于尺寸小、数据点少，其Hi-C热图固有的结构清晰度就是不如大的染色体。目标不是让13号染色体看起来和6号一样“好”，而是优化整体13张图的展示效果，并从分析中获取有效信息。
1.​​计算全局指标进行客观比较​，而不是只看热图。

2.为每条染色体单独优化​

建议以生物学真实存在的情况为准
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