老师,这是我的gene.list和其他文件的基因,不是只有一个,而且也能对上,但是做domaindomain_final.bed的时候就只有一个基因,我试了WRKY和FAE1这两个家族,都会出现这种情况

attachments-2025-06-XXtzAlox6849701b550aa.png这是手动找出来的基因,在docker里list也是没问题的,检查了其他文件也没问题,基因也能对上很多attachments-2025-06-6sgjWrBC6849707fc4f3c.png

这是之前WRKY的截图,只有一个,后面做FAE1也是一模一样的情况

是list里面的基因格式有问题么?文件里是这种BnaA01G0038300GG BnaA01G0038300GG=476,我把后面那部分去掉了

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1 个回答

rzx

不太清楚你说有错误的文件是做哪步分析得到的结果文件有错误。你是基因家族成员鉴定之后提取domain序列的时候出现问题的吗?是运行那行代码有问题的?可以把运行的代码和代码用到的文件截图出来。

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