用ALLHIC挂载时,划分Group出现问题

我组装的这个物种的基因组大小为 400 Mb,一共12条染色体,在 划分GROUP的时候,其中第一条GROUP很长,有 395 Mb,其余都很小。如下:

      1.   sample.clean.counts_GATC.12g1   394863216

      2. sample.clean.counts_GATC.12g10  160144

      3. sample.clean.counts_GATC.12g11  117827

      4. sample.clean.counts_GATC.12g12  63024

      5. sample.clean.counts_GATC.12g2   1098658

      6. sample.clean.counts_GATC.12g3   1010580

      7. sample.clean.counts_GATC.12g4   530669

      8. sample.clean.counts_GATC.12g5   517891

      9. sample.clean.counts_GATC.12g6   473041

     10. sample.clean.counts_GATC.12g7   359490

     11. sample.clean.counts_GATC.12g8   323377

     12. sample.clean.counts_GATC.12g9   300824 

  这是 那个地方 出现问题了呢?

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1 个回答

Ti Amo

3D DNA手动切割一下,要么就打碎重新跑一下。ALLHIC有自己的打碎重跑流程。

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  • 郭老师 提出于 4天前

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