根据组装后基因做的物种注释,还需要做稀疏曲线吗

因为count值使用salmon计算非整数,无法进行稀疏曲线的绘制。如果审稿人问的话可以用read的稀疏曲线回复表明测序深度足够覆盖吗

请先 登录 后评论

1 个回答

xun - 电路元件工程师

因为组装的时候其实有组装质量的结果,n50那些,这些其实一定程度上可以代表结果质量

稀疏曲线一般不用在组装序列里,因为这种情况既和测序有关,又和组装质量有关


审稿人一般不太会问这个,如果问到了直接回复基因组覆盖率,或者组装质量什么的跟好一点

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,55 浏览
  • murakami 提出于 1天前

相似问题