微生物与环境因子,代谢物,功能等相关性分析linkET

微生物与环境因子,代谢物,功能等相关性分析linkET

  • 1
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2023-12-19 08:20
  • 阅读 ( 555 )

PICRUSt2扩增子功能预测与差异比较分析

PICRUSt2扩增子功能预测与差异比较分析

  • 1
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2023-10-24 11:42
  • 阅读 ( 923 )

方差分解分析(Variance Partitioning Analysis)

方差分解分析(Variance Partitioning Analysis)

  • 0
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-22 20:19
  • 阅读 ( 13095 )

qiime2 分类器建立 SILVA数据库

https://forum.qiime2.org/t/processing-filtering-and-evaluating-the-silva-database-and-other-reference-sequence-data-with-rescript/15494

  • 0
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-21 08:24
  • 阅读 ( 7923 )

qiime2 vsearch OTU 以及 ASV流程整理

qiime2 vsearch OTU pip 整理

  • 0
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-06 13:17
  • 阅读 ( 7827 )

Bugbase表型预测

微生物多样性分析物种表型预测

  • 1
  • 1
  • Morii
  • 发布于 2020-11-03 17:19
  • 阅读 ( 9496 )

JGI-IMG微生物功能基因组数据库介绍

JGI-IMG微生物基因组数据库介绍

  • 1
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2020-09-10 15:16
  • 阅读 ( 11620 )

picrust2用法

picrust2用法

  • 0
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2020-08-23 20:02
  • 阅读 ( 3092 )

BIOM 微生物数据格式及文件转换

BIOM 微生物数据格式

  • 0
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2020-08-17 11:20
  • 阅读 ( 8671 )

微生物多样性16S计算物种累计曲线

R语言 vegan包计算物种累计曲线

  • 0
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2020-01-15 13:38
  • 阅读 ( 6540 )

微生物多样性扩增子(16S/18S/ITS)课程更新v2.0

微生物多样性扩增子(16S/18S/ITS)课程更新v2.0

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-12-05 13:25
  • 阅读 ( 566 )

泌尿感染(UTIs)宏基因组分析

泌尿感染(UTIs)宏基因组分析

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-11-26 21:25
  • 阅读 ( 326 )

qiime2 q2-picrust2 报错问题

qiime2 q2-picrust2 报错问题

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-10-30 13:21
  • 阅读 ( 479 )

picrust1 16S 微生物功能预测

picrust 16S 微生物功能预测

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-10-18 15:16
  • 阅读 ( 353 )

lefse 运行报错python3中

lefse 运行报错python3中

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-10-18 14:38
  • 阅读 ( 434 )

宏病毒组分析一区

宏病毒组分析一区

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-09-07 09:28
  • 阅读 ( 477 )

kraken2生成的biom文件处理

使用kraken2软件做宏基因组或扩增子项目物种注释项目的时候,如果后续不使用bracken则可能会遇到一个问题,结果生成的biom文件中taxonomy并不是最终结果,比如下面这样 可以用脚本来处理,删...

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2023-05-31 17:33
  • 阅读 ( 766 )

组学大讲堂QIIME2(v1.5)镜像更新说明

对于qiiem2更新细节的一些描述

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2023-01-06 13:26
  • 阅读 ( 1870 )

qiime2 安装-使用国内镜像避免网络原因报错:

qiime2 安装-使用国内镜像避免网络原因报错:

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-10-29 10:07
  • 阅读 ( 1847 )

微生物多样性分类柱状图按照分组进行排序脚本升级;tax_bar_plot.r

微生物多样性分类柱状图按照分组进行排序脚本升级;tax_bar_plot.r

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-07-27 11:11
  • 阅读 ( 1233 )