linux 从文件中随机抽取部分数据

如何从某一个文本文件中随机抽取一部分数据。譬如右下方这样的基因表达量数据的统计文件ref_trans_full_table.xls目标是由此文件中随机抽取一部分数据。 可以利用shuf获取随机数据,譬如随机...

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-31 17:04
  • 阅读 ( 4513 )

linux的简单命令(二)

linux常用命令 1:创建文件和和文件 mkdir+yangsm#表示 创建一个yangsm的一个文件夹 vim+yangsm.txt#表示创建一个yangsm.txt的一个文件 2:在vim文件中如何退出 a、Esc b、ctrl+;#可以加...

biolinux共享目录文件夹建立及注意事项

biolinux共享目录创建及注意事项。

  • 1
  • 2
  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-05 18:38
  • 阅读 ( 10249 )

linux处理fasta和fastq序列

linux命令处理fasta序列

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-21 22:46
  • 阅读 ( 7565 )

linux下解压命令

在下载或上传文件时,会碰到很多压缩文件,种类较多,这里就介绍一下各种常见类型的文件如何压缩以及解压缩

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-06-14 17:44
  • 阅读 ( 1785 )

fastq文件查看指定序列

在处理fastq文件时,可能会遇到序列与质量值长度不一致或格式不正确等问题,这时候软件会报告哪条序列有问题,并给出序列ID,然后我们就要去查看这条序列是什么问题。但是,fastq文件通常是很大的,使用less命令可能很难搜索到

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-06-08 11:48
  • 阅读 ( 6988 )

Bio-Linux中的生物信息学软件

Bio-Linux中有很多安装的生物信息学软件,这里给大家列举一下:

  • 4
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-06-06 17:49
  • 阅读 ( 10747 )

linux系统中ls命令的常用用

ls命令是linux下最常用的命令。ls命令就是list的缩写,缺省下ls用来打印出当前目录的清单,如果ls指定其他目录,那么就会显示指定目录里的文件及文件夹清单。通过ls 命令不仅可以查看linux文件夹...

  • 1
  • 0
  • landy
  • 发布于 2018-06-01 13:18
  • 阅读 ( 2354 )

linux 命令当中出现特殊字符无法传递参数怎么办

命令行特殊字符处理方法

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-31 11:03
  • 阅读 ( 7870 )

awk基本参数解释

awk擅长于对文件按行操作,每次读取一行,然后进行相应的操作。 awk读取单个文件时的基本语法格式是 awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}{print $0, $1;}' filename 读取多个文件时的语法是 awk...

  • 0
  • 2
  • landy
  • 发布于 2018-05-25 10:29
  • 阅读 ( 3010 )

awk筛选差异基因

命令行筛选差异基因

  • 0
  • 1
  • landy
  • 发布于 2018-05-24 18:03
  • 阅读 ( 3775 )

linux下替换文件中的换行符

之前在linux系统执行以下命令: ls file |xargs sed -i 's/\n//g' 然而却发现没有任何效果,百度之后发现 sed是按行处理文本数据的,每次处理一行数据后,都会在行尾自动添加trailing newline...

  • 0
  • 2
  • 安生水
  • 发布于 2018-05-24 10:35
  • 阅读 ( 6009 )

linux:简单使用(2)

linux

linux的简单命令(一)

linux

linux常用命令整理之文件解压缩:

linux常用命令整理之文件解压缩:tar命令:解压:tar xvf FileName.tar压缩:tar cvf FileName.tar DirName gz命令解压:gunzip FileName.gz压缩:gzip FileName zip命令解压:unzip File...

  • 0
  • 1
  • landy
  • 发布于 2018-05-18 13:03
  • 阅读 ( 2026 )

awk 判断并筛选数据

在linux上利用awk对数据进行筛选,并输出

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-17 09:41
  • 阅读 ( 7341 )

vi基本替换

利用vi实现文档的搜索替换

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-05-11 15:52
  • 阅读 ( 1892 )

linux命令如何对两个文件去重复

例如你有两个基因id文件,你想知道这两个文件共有的id,怎末办呢?一行命令就可以解决。cat     文件1  文件1  |sort|uniq    输出的就是这两个文件的并集cat     文件1  文件1  |sort|uniq   ...

  • 0
  • 0
  • landy
  • 发布于 2018-05-11 13:54
  • 阅读 ( 2211 )

biolinux 挂载虚拟目录注意事项

biolinux

  • 0
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-27 23:13
  • 阅读 ( 3148 )

biolinux 虚拟机内存不能为written怎么解决

biolinux虚拟机导入之后打开报错

  • 2
  • 2
  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-27 21:27
  • 阅读 ( 5227 )