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老师 就是 您在重测序课程里面里面用vcftools工具过滤和群体遗传过滤的条件有一点不一样 那个才是对的或者两个都对 我截屏放一次下面啦 您看一下
烟雨易冷
2025-01-04 11:01
1
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老师 就是 我在过滤数据的时候 下面截屏中利用vcfutils.pl进行过滤的时候 生成的文件还有7.2 Gb,但是用vcftools进行过滤后还剩764Mb的文件,这个是不是过滤掉的太多啦呀 麻烦您重新帮我设置一个过滤参数嘛 谢谢我重测序的个体才36个
vcftools
烟雨易冷
2025-01-04 08:31
1
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老师,就是我在做结构变异分析那里,我重测序分析的个体只有36个 下面我用红色箭头指的那个参数和值为30的这两个参数设置为多少比较合适呀,谢谢老师
烟雨易冷
2025-01-03 19:21
0
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老师,就是我在做结构变异分析那里,我重测序分析的个体只有36个 下面我用红色箭头指的那个参数和值为30的这两个参数设置为多少比较合适呀,谢谢老师
烟雨易冷
2025-01-03 19:20
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请问您是如何找出是哪号样品的哪个染色体的相关文件有错误的呢
刘傲傲
2025-01-03 16:41
0
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384
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请问您是如何找出是哪号样品的哪个染色体的相关文件有错误的呢
刘傲傲
2025-01-03 16:40
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遗传图谱分析课程
Mr Dong
2025-01-03 09:52
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二代和三代sv数据合并出现问题,若能回答,万分感谢
合并sv
小钱洋洋
2025-01-02 21:52
0
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群体sv分析
群体结构分析
小钱洋洋
2025-01-02 21:42
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线粒体基因组组装挑选contigs的标准是什么?
陈黑手
2025-01-02 20:49
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您好,想请教一下 linux中 R语言安装magick的包装不上的问题
小胖子
2025-01-02 18:20
0
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hmmsearch 关于参数--cut_tc设置
单恋一枝花
2025-01-02 15:38
1
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binning 想做功能注释,但还是不知道该用哪些文件进行基因预测和功能注释?
宏基因组
George
2025-01-02 14:56
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546
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binning物种注释的时候,gtdbtk软件和数据包已经更新,旧版的匹配不上,请问应该怎么更新一下软件,谢谢
宏基因组
George
2025-01-02 11:44
1
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603
浏览
想咨询一下,可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程?
George
2025-01-02 02:39
1
回答
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浏览
想咨询一下,可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程?
宏基因组
George
2025-01-02 02:39
1
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784
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想咨询一下,宏基因组功能注释的视频中,有一步是用cds.fa文件注释物种,想咨询一下,这个物种注释出来后,应该如何计算丰度?是根据前面cds.count来计算吗,这样计算出的物种丰度可靠吗?因为有些物种可能基因很多。
宏基因组
George
2025-01-02 02:36
1
回答
818
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请问,我弄了一个256线程,1t内存的服务器,想处理500G的宏基因组注释,大概需要跑多少天,全套下来
宏基因组
George
2025-01-01 07:11
1
解决
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5
0
2024-12-31 12:09
0
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GATK报错Caused by: java.io.IOException: Input/Output error
gatk4 HaplotypeCaller
YYJ
2024-12-30 20:45
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