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有个问题想请教一下大家，从数据库中下载的原始数据的gff文件，他们是怎么得到这些基因的注释信息的的，测完序后根据序列比对吗？

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老师您好，我有个问题想请教您，就是以您看的文献来说，您觉得有转录因子调控CDPK激酶的文献，就是说转录因子可以和CDPK激酶的启动子结合的例子吗？因为我用某个CDPK酵母双杂交筛到了一个转录因子，现在不确定到底是这个转录因子结合了CDPK的启动子，还是这个CDPK激酶对这个转录因子磷酸化，对于它们的上下游关系我还不是太明白，是不是用CDPK筛到的转录因子就说明了什么关系呢它们之间

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请问如何根据已有转录组预测转录因子的靶基因？

  • 2019-10-23 18:21
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您好您看我挂机了为什么还是打不开这个TXT啊

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gzip: Phaseolus_vulgaris.PhaVulg1_0.45.gff3: Protocol error

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转录组中count值为什么要经过标准化，计算FPKM值来表示表达量？

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转录组数据里的count值是指什么？

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5 Tbtool中Quick Mscanx Wrapper使用的时候总是得不到结果

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3 Failed to open tabular per-dom output file zf-C2H2.txt for writing怎么解决

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宏病毒组得到的contig如何做系统发育分析，包括如何选取合适的序列？contig是否需要截取相应的基因片段？如何截取？

  • 2019-10-22 13:47
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请问用TBtools在进行 进化树+基因结构+motif—1张图全显示的时候，只做motif和进化树的组合可以显示,加上基因结构的gff文件就不行了，认为是基因ID不一样导致的。请问gff文件应该是什么样子的啊

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老师，有没有关于基因定位的一系列课程，初步接触，想了解了解大体过程

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想问问进化树外面的各个亚族的环是怎么做的，第二就是树枝末端的形状怎么做成不一样的

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20 老师你好，blast分析串联重复基因结果文件duplication_gene.out与MCScanX 结果文件 tandem的串联重复基因不一致怎么解释？

  • 2019-10-21 15:38
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20 在利用脚本得到重复基因的时候出现了报错open failed

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转录组差异分析里GO注释的图怎么看的？

  • 2019-10-21 11:04
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请问预测信号肽或者蛋白质亚细胞定位是用什么方法做的呢？谢谢老师

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5 想问一下用做药物作用后的itraq标记质谱分析蛋白的变化？对照组是113和114，实验组是115,116,117，那如果得到了115/113,116/113,117/113,115/114,116/114,117/114这些都是实验组与对照组倍数变化fold change 以及他们对应的p值，那我怎么用，筛选的时候要用这六个比值的均值吗？还是有其他的筛选办法？还有六个p值应该如何来筛选？

  • 2019-10-21 00:30
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建立共享文件夹失败错误提示wrong fs type, bad option, bad superblock on bioshare

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hmmsearch的选择