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5 老师，使用非ensemble数据库的蛋白质序列和基因组染色体fasta文件脚本要怎么进行修改呢？

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ensemble下载的gff3和toplevel文件无法解压

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docker

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老师您好，之前的链接失效了，可以麻烦您再发一次吗

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你好，请问如何将cg号转为基因名？

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老师们好，这是我的基因定位在染色体上的位置，总共的scaffold数有3864个，但是七鳃鳗里面染色体有72条，所以这里怎么转换我不明白，我这个里面它好像默认了scaffold就是染色体一样，我不知道怎么去转换

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老师，我用hmmsearch 没搜索出结果，然后用拟南芥的query.fa和我要分析的物种cds进行blast分析，比对出来的基因只有几个，我老师说我要做的基因有200多个，完全对不上，不知道该怎么办了，请教下老师。

  • 2022-01-25 20:55
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qiime2的微生物16s全基因组序列的分析方法及思路

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我想问下 生信引物设计的课 里面用docker上面的ssr引物设计程序设计出来的引物 是经过E-pcr筛选的吗 我看课里老师介绍了pl文件介绍里面有E-pcr程序 但具体有没有运行呢

  • 2022-01-24 10:00
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老师您好，我在做不同物种之间共线性分析的时候，在#绘制共线性图片：准备两个配置文件为输入文件出现如下错误：IOError: [Errno 2] No such file or directory: 'mcscan_layout'

  • 2022-01-24 02:26
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您好，请问一下 Failed to open sequence file GCF-000001735.4-TAIR10.1-protein.faa for reading，hmmsearch出现这种怎么解决呀

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有关群体pop_Group.txt的问题，最大可以分几个组，如果分组太多怎么修改脚本的颜色设置

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HGMD数据库

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使用SummarizedExperiment包的assay提取miRNA数据的表达矩阵时报错是什么原因？

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MEGA

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Deseq分析差异表达基因时，我按照转录组自主分析课上教的方式运行，一直出现Error in `[.data.frame`(ori_data, , as.vector(f_mat[, 1]))，导致无法进行。想请教一下，如何解决这个情况。

  • 2022-01-21 04:53
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hisat2软件做转录组数据比对时出现的一个报错，百思不得其解，求各位大佬帮忙看下

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用TBtools绘制两个物种的三连图

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老师您好，我这边在进行扩增子数据处理时，进行到生成OTU_table时总会报错，报错信息如下，请问这是什么问题呀