3 求教各位老师:请问为何测序公司三代转录组测序给出的CDS有很多不是ATG开头?

求教各位老师:请问为何测序公司三代转录组测序给出的CDS有很多不是ATG开头?我测的是真核植物,我的理解是真核生物CDS不是以ATG开头么?事实上很多确实都是以ATG开头的,但是就是大约有1/3测的的CDS序列是以什么GGG,GCG之类的碱基开头。无法理解啊,还请各位老师答疑解惑,拜谢各位老师!

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1 个回答

生信老顽童

这个三代测序:
1、不一定都是全长的转录本

2、有些测序会测到基因上游的一些序列或者内含子序列

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