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GATK HaplotypeCaller - Shutting down engine

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安装好Docker以后，搜索出的镜像没有TAG ID，按照给的命令下载镜像也是失败 no such host

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gatk报错：java.lang.IllegalStateException: Read position too high for BAI bin indexing.

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转录组上游分析之定量比对Hisat2出现内部异常错误

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您好老师，Ka/Ks计算，扩展运行内存后，任务仍然被杀死，这两个基因为串联重复，其中一个基因存在大量缺失。请问这种情况怎样计算

  • 2021-09-14 16:53
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请问你通过利用NCBI下载sra数据提取自己想要的基因表达量做出来了吗？可以分享一下操作流程吗？万分感谢！

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10 老师您好，我购买了扩增子的课程，在做分析时遇到如下问题：我是混样后侧的序列，结果只有一个fasta格式的序列结果。但是跑课程中的代码是把每个fasta文件加序列号改成符合qiime的格式再合并。而我一开始就是合并在一起的文件，想问有什么办法把合在一起的文件拆分成多个fasta文件吗？或是直接在合并好的文件里直接加序列号从而符合qiime格式吗？谢谢

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E-value值筛选

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老师你好，问一下如果所做物种只有基因组数据，没有转录本，CDS等文件，该用什么软件分析得到别的数据

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5 老师好，我可以用windows桌面版的docker在powershell上利用ssh命令链接到服务器进行重测序数据分析嘛，之前直接用笔记本不连服务器感觉电脑要炸了烫的，在服务器安装docker几次都失败了，买了安装课程可是只有windows的安装教程，还是没搞定

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根据课程基因组重测序的脚本，进行片段inner size，片段选择是否异常和测序深度与覆盖度统计均未能生成pdf文件，直接弹出如下对话框和如下命令

  • 2021-09-12 14:16
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$motif{++$nr} = $motif; 麻烦直接解释一下{++$nr} ，代表的意思谢谢

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拿到结题报告后，该如何入手分析数据呢，大佬们，希望回复！！！

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没有使用biolinux虚拟机，可以自己在电脑上下载meme-4.12软件进行下一步嘛？

  • 1111 2021-09-09 16:23
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这是提取SSR,标记的脚本，{ my $redmotif = "([ACGT]{$j})\\1{".($motiflen/$j-1)."}；"my $search = "(([acgt]{$motiflen})\\2{$minreps,})"；这句代码代表啥意思，特别是\\1{".($motiflen/$j-1)."\\2{$minreps,}这两句代表啥意思

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CIRCOS共线性作图

  • 荣 2021-09-09 10:33
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看了perl 语言高级编程课后，对这句脚本不理解my $redmotif = "([ACGT]{$j})\\1{".($motiflen/$j-1)."}";请帮忙解释一下，谢谢，特别是这句\\1{".($motiflen/$j-1)."}

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你好，我不小心把镜像下载到C盘了，不小心爆盘了。有办法解决吗？ windows

  • 2021-09-09 09:38
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R包ridge 安装报错

  • 2021-09-08 11:39
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lasso cox 进一步筛选预后基因（排除共线性），简化模型

  • 2021-09-05 23:45