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5 做完GWAS分析有必要做转录组测序进行关联验证么？

  • 2019-01-11 16:27
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老师，你们好 请问怎么知道一个植物的基因组是否测序？比如芦苇的

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5 预测启动子顺势作用原件

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基因结构分析

  • 2019-01-11 11:08
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5 在 “微生物OTU网络图绘制(Cytoscape)”课程中，二分网络图中，除了找出每个组特有OTU外，如何通过filter找出组间“共有的”OTU，并用其他颜色显示？

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GEO数据的处理问题（没有NCBI官方注释文件情况）

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基因家族全基因组文件如何选择？条目太多，不知哪个是教学中讲解的protein.all文件/cds.all文件/cdna.all文件？还望老师讲解一下每个文件中具体包含的是哪些信息？衷心感谢！

  • Tong 2019-01-10 21:12
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无参转录组结果中，组装的转录组本有预测的蛋白序列吗？在什么位置？

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5 老师，您好！我在网易云课程上学习《微生物16S/ITS/18S/分析原理讲解》课程，我想自己操作，我想跟您要原始数据、qiime命令和R绘图代码可以吗？

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数据分析

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TCGA数据库下载基因表达数据TXT文件

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5 想请教下，就是我测了种子五个不同发育时期的转录组，想通过转录组数据中的表达量筛选出几个候选内参基因，用什么条件筛选呢？

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TCGA数据中primary site数据下载

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3 我用CIRCOS画图，文字标签叠加了要怎么弄到同一水平？

  • 2019-01-09 17:12
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5 利用蛋白ID获取基因ID时 所获得文件少一列

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老师，我在却时出现这样的情况是因为颜色不够用了吗，有没有办法增加色板颜色呢？谢谢老师。

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我从unigene序列预测到ORF，对应的cds序列直接用于引物设计就可以了吗？谢谢

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5 关于基因家族中的串联重复基因的删选、Ka/Ks的计算、串联重复基因Circose图的分析有相关的文献吗？

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链特异性文库转录组有什么优点？

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为什么高通量测序很多reads会比对不到参考基因组上？为什么？