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Linux服务器上，运行提取结构域的脚本的时候，出现未安装Bio/SeqIO.pm in @INC的错误，请问如何安装，或者能够在服务器上运行的脚本

  • 2020-12-09 21:29
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在基因家族分析的时候对GFF文件中mRNA与gene ID对应关系的脚本进行运行时出现如下无效的问题，请问怎么解决

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10 http://peppersequence.genomics.cn/

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共线性分析得出的基因对可以用于kaks分析吗？还是只有串联重复的基因对才可以用于kaks分析啊？

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motif分析中出现错误

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3 共线性绘图报错。看了别人的帖子解决不了 ZeroDivisionError: float division by zero

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提取结构域序列

  • 荣 2020-11-28 15:33
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5 基因家族分析meme用了课程虚拟机，装了biolinux（课程中的），运行之后出现了这个问题，请问什么原因

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串联重复基因

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请问我用Evolview美化进化树时，为什么图片输出的不完整，有四百多条序列？

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老师好，这是在docker里用了咱们给提供的镜像，在biosoft里面没有meme，是什么原因啊

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。

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老师您好，请问在构建进化树的时候，发现分组与拟南芥中的不同，比如A4分组被分开了，请问有什么解决方法吗？谢谢老师

  • 2020-11-16 09:51
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GFF文件不能获取基因与mRNA的对应关系文件

  • 荣 2020-11-16 09:31
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请问大家在构建进化树的时候，发现分组与拟南芥中的不同，比如A4分组被分开了，请问有什么解决方法吗？谢谢

  • 2020-11-15 20:10
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GFF文件不能获取基因与mRNA的对应关系文件

  • 荣 2020-11-14 01:04
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动物基因顺势作用元件的预测

  • 2020-11-11 16:47
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5 hmmsearch新建HMM模型之后再次搜索出现报错，请问老师什么原因

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问一下老师们，在用get_genefamily_bed.pl 这个脚本，提取自己基因家族位置信息的结果文件总是为空，下面是为的输入文件。perl get_genefamily_bed.pl -in1 SAT.IDlist.txt -in2 Oryza_sativa.IRGSP-1.0.47.gff3 -out MtN3_SAT.bed执行的是条命令。

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5 各位老师好，我买了你家的基因家族的课程，我咨询一下几个问题：（1）我分析NBS-LRR基因家族，其中CC结构域没有hmm文件，你们分享的文献中说用Paircoin2软件，我想问一下，这个软件怎么使用；（2）我用figtree美化进化树，为什么树枝上的Bootstrp是小数，而不是MEGA建树中的整数。