利用hmmsearch检索出来的蛋白序列太少

attachments-2021-02-AMQO83Ig601e0de42c556.png老师,您好!我按照组学课堂基因家族分析课程操作,输入以上命令后,检索出来的蛋白ID只有几个,这是从拟南芥数据库筛出来的。请问是不是bio-linux默认的阈值太小了? 我使用 hmmsearch -h 找到了 --domT ,但是不会设置阈值。

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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

自己看文献和看hmmer的说明文档吧:https://www.omicsclass.com/article/499

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  • 别扒拉我 提出于 2021-02-06 11:37

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