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T2T基因组调研图中jellyfish -h和genomescope.R -m 都是设置的10000000，设置的依据是什么，不同作物有差异，怎么选择参数呢

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vcf文件如何合并

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重测序中SNP分析

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重测序中SNP分析

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10 群体遗传分析中iqtree构建系统进化树出现警告和错误

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按照课程输入命令，但是报错显示没有这个命令

  • zjc 2025-04-23 11:14
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老师，您好，我正在泛基因家族分析，想问课程中用到的结构变异的vcf文件all_merge.vcf是泛基因组全基因组范围的变异吗，

1 解决

Hic挂载时 K值选择

  • _He. 2025-04-23 08:48
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基因家族分析

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求老师解答，docker run 出错

  • Oho 2025-04-20 11:38
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braker注释结果有问题

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用GATK call 变异的时候，分染色体还是很慢，能不能增加线程或别的改进的方法。

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10 求助，有没有用过smudgeplot做过倍性分析的大佬，对psmudgeplot.py plot参数有疑惑，请问应该然后解决，感谢

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利用GATK 分染色体call 变异时出现错误

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宏基因组分析老师上课的内容。

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根据没有标识转录本是1还是2或3的IDlist基因号名单，在标识了转录本的蛋白质序列文件中搜索，可以把IDlist名单中的所有转录本蛋白序列搜索出来吗？可以改命令达成？这是我的命令seqkit grep -f Nramp_IDlist_final.txt arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.CCJH.protein.faa -o Nramp_pep_final.fa 我把IDlist里面名单后面都加了转录本号才搜出来。？

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GATK 很慢，怎样分染色体CALL 变异

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我在做T2T，docker下载T2T镜像错误

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老师，我正在做泛基因家族分析的结构变异与基因注释部分，出现一些错误

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基因家族分析之基因结构分析

  • 荣 2025-04-16 23:03