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泛基因家族成员选择压力分析中,构建的热图,很奇怪,我需要如何更改?
胡胡
2025-02-16 19:03
2
回答
718
浏览
IBD 计算2
IBD分析
随风
2025-02-16 18:33
1
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IBD计算1
IBD分析
随风
2025-02-16 15:58
0
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下载VirtualBox,显示 安装时发生严重错误 是为啥啊?
安装软件
小晴空
2025-02-16 15:38
0
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浏览
老师,请问泛基因家族成员鉴定中,hmmer结构域搜索;;我有两个结构域,而hmmersearch一次只能筛选一个结构域;请问如何筛选同时含有两个结构域的呢;请问这两条指令如何修改?
胡胡
2025-02-15 10:25
2
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656
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IBD计算
IBD分析
随风
2025-02-15 09:04
1
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595
浏览
3
请问,在3个数据库中进行结构域确认时,为什么我出不来和老师一样的结果,是不是使用的_pep_need_to_confirm.fa文件里面基因名称一行需要修改?
泛基因家族
Connie
2025-02-14 20:42
1
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493
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命令无法运行
郭老师
2025-02-14 16:27
2
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老师,我更换镜像了,但本地镜像一直加载不了,显示如下。然后,我在服务器上,导入镜像,运行docker run -it --rm --name pangene --group-add keep-groups -v /home/us132/pangene:/work localhost/omicsclass/pan-gene-family:v2.0做了泛基因集构建。之后继续做其他分析,然而,运行镜像时一直出错,进不去,错误显示如下。
泛基因组分析
Connie
2025-02-13 15:34
1
回答
635
浏览
请问下你docker search omicsclass怎么解决的,我也遇到了一样的问题
docker
刘帅
2025-02-12 23:05
1
回答
628
浏览
请问下你docker search omicsclass怎么解决的,我也遇到了一样的问题
docker
刘帅
2025-02-12 23:05
1
回答
597
浏览
老师,想问一下我泛基因集构建生成的last.gene.pair.txt文件是乱的,这个怎么办呢?应该怎么统一一下呢?
泛基因家族
胡胡
2025-02-12 18:36
1
回答
594
浏览
老师,在泛基因集构建时JCVI的比对,出现以下错误
泛基因家族
python版mcscan
胡胡
2025-02-12 17:25
0
回答
781
浏览
在运行table_annovar.pl脚本的时候报错
泛基因组
间歇性神经病
2025-02-12 16:46
1
回答
648
浏览
泛基因家族分析时,泛基因集构建与家族成员分析用的镜像不同,有区别吗
泛基因家族分析
Connie
2025-02-12 16:38
1
解决
438
浏览
老师,我正在执行泛基因及构建的12-30行的指令;视频中data数据中为gff的后缀,我的数据是gff3的,把他后缀改成gff重新上传一遍在执行这条指令吗?
胡胡
2025-02-12 11:50
2
回答
629
浏览
5
请问利用jcvi整理泛基因列表,做JCVI做共线性分析时,一直提示/bin/bash: lastdb: command not found,是没有安装Last软件包吗?目前使用的镜像是购买课程时老师提供的,数据是26个玉米基因组数据(由于空间不足,只用了19个基因组)
泛基因家族
Connie
2025-02-11 15:34
1
回答
588
浏览
修改样本名称
bcftools
随风
2025-02-11 14:29
1
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429
浏览
hmmsearch --domtblout ./${ind}.WRKY_hmmerOut.txt --cut_tc ./WRKY.hmm ./${ind}.gene.pep.fasta;;我有两个结构域,需要如何更改呢?
胡胡
2025-02-11 11:51
0
回答
448
浏览
运行hmmsearch返回结果为空,后来再试时报错
158****2023
2025-02-11 11:04
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