使用eggnog对组装后的基因进行CAZy和EC酶的注释，一个序列会注释到多个正常吗？另外我还想问一下进行lda分析时，未注释到的功能或者基因应该删除吗

我在相关的文献里并没有发现EC酶或者CAZy酶多个情况

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1 个回答

xun - 电路元件工程师

当然是正常的,数据库层级都是类似的,kegg会出现的问题其他地方也是一样的

按理说这个在文献肯定是不罕见的,你可以在看两篇,比如这个cazy 的,他一般是按结构域分的,一个蛋白可能有多个结构域,所以重叠一下是很正常的

lda 的时候没注视到的基因一般是删除,因为没有功能就没有后续,删掉也可以简化解释,
但是如果本来就后面不做了,那删不删都随意了,

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  • murakami 提出于 4天前

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