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blsatp，我想拿发表文献的基因ID的蛋白序列和我自己搜出来的序列（$species.gene.pep.fasta）比对。我先是把这两个序列放在一起。然后再建库比对。出现问题。怎么办？后来我在那个gene.pepe.fasta中选择几个序列和发表文献的序列放在一起建库比对就能行。原因是什么？我

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ParaAT批量比对，该怎么执行+X？

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拟时分析筛选出的差异基因数量太少，有没有可以调整的参数去增加筛选数量

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Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r -i pvalue_$m.txt -F $FAI -T Sugar_$m -n Sugar_${m}_manhattan -c 1.3e-6绘制曼哈顿图时，输入这段代码后，报错，显示颜色数量不足，怎么解决

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docker

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Rscript $scriptdir/gapit_gwas.r -i /work/hapmap.txt.gz -t /work/Sugar.txt -m GLM -n hd.GLM.GWAS.Results 就是我执行完这个命令，一直在这个界面，等一个多小时都没反应，hapmap文件大小260M，是还在运行，还是哪里错了

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单细胞测序使用subset脚本提出子集，再进行拟时分析报错plot_genes_by_group

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老师，您好，我在运行gatk的HaplotypeCaller时主脚本通过 SLURM 调度系统提交作业，使用 GNU Parallel 并行处理多个样本并调用 HaplotypeCaller 脚本，目前运行了约六七个小时，我的工作日志.err和.out都为空这是正常的吗？

  • Geő 2025-05-14 17:06
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单细胞测序分析最后的差异基因表达热图生成有问题

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共享性分析图片美化像这样字体盖住了该如何修改绘图的代码？

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组内共线性分析，为什么不能出图呢？

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老师您好，我在做物种间多线性分析时出现如下错误，希望您可以帮忙给看看，感谢！

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老师您好，我做MCScanX 进行blast建库时总是报错，文件前加上绝对路径也还是报错显示文件不存在

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可以分析多个序列中两个序列的相似性吗？下图有多个序列，这么比对后，发现两个一样的序列都无法配对。如何比对多序列的两个序列。

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5 单细胞测序进行拟时分析绘制细胞骨架图

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perl $scriptdir/vcf2hmp.pl all_clean.vcf.gz hapmap.txt.gz始终显示找不到脚本，但脚本在我设置的路径中，不知道该怎么解决

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基因注释后进行β多样性分析时报错

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bash:docker:command not found是什么情况，还有就是根据我这个目录如何运行docker run --rm -it -v /share/work/huangls/piplines/omicsclass/pop-evol-gwas/scripts/:/work/scripts -v /share/nas1/huangls/test/gwas_rice:/work omicsclass/pop-evol-gwas:v2.0这条命令，怎么进行修改

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进化树制作，背景我设定的只是一段，为什么提交之后全部基因都有背景。

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运行MCScanX查找共线性，java绘图出现错误为什么？