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blast比对得到的基因进行构树，无法与拟南芥基因进行聚类

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T2T基因组组装和注释18步

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命令行复制

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T2T基因组组装与注释第18步

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老师，我提取cds ，pep用基因的ID，作为序列的ID命令。运行出来"No such file or directory; can't open file ./.longest_isoform.gff3"但是我打开输出文件看是有数据的。是不是不用管No such file or direc...提示

  • aa1 2025-01-09 16:36
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重测序

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老师我在做泛基因家族分析里面的泛基因列表构建，生成last.txt文件非常慢，帮忙修改命令

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老师您好，如何批量提取不同基因组中的同源基因家族成员

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想咨询一下，可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程？

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搜集的gff3文件；第一列不同，有的是chr，有的是id；这个影响吗？

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老师，我在做饭基因家族分析，我搜集的基因组的gff3文件，第一列有的是chr有的是基因id，这个会影响后续结果嘛？

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老师您好，在做连锁不平衡分析的时候出现这样的结果要怎么解决啊

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宏基因组单独组装后的contigs需要注明来源以构建基因丰度表，混合组装呢

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T2T基因组组装与注释17步

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老师 我想问一下就是这个snp的统计是哪里呀 我视频里面看啦 说是SNP_gene_ann.stat里面的最后一列total ，但是我统计出来有一千五百多万，才36个个体 会不会太多了呀，还是直接wc -l对vcf文件进行统计呀

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线粒体基因组组装挑选contigs的标准是什么？

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老师 你们这里给的是不是有一些代码没有 ，我就是按照你们给的元宝枫的数据和代码一步一步做的 花式出现下面的错误

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SNP数据统计

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重测序

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基因组组装着丝粒问题