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T2T基因组组装，去除自冗余，发现是minimap2 -D -cx asm5 -t 10 tmp1.fa tmp1.fa > tmp1.self.paf 命令产生的tmp1.self.pa文件中有各别行输出结果有问题（17[M::worker_pipeline::1636.730*6.86] mapped 12 sequences），后续awk命令报错。如下图

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LD绘图

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RNA-SEQ分析中，基因ID位于Chr01-Chr09的基因的reads数目全部是0

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蛋白3D结构预测

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Error response from daemon: Get "https://index.docker.io/v1/search?q=omicsclass&n=25": dialing index.docker.io:443 container via direct connection because has no HTTPS proxy: connecting to index.dock这是

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16S课程 03.asv_taxonomy

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泛基因家族成员鉴定

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单细胞转录组课程findallmarker中的KEGG和GO富集分析，对于不是模式植物的物种怎么进行富集分析

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GWAS分析绘制QQ图时，Observed值与Expected值相差较大

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泛基因家族分析

  • 2025-07-28 09:44
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进行GTDB注释时报错，报错信息为缺少参考基因组

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老师您好，我想咨询下关于这篇文章中《华大stereo-seq 添加上底片转换成10X格式方便scanpy和seurat读入分析？的gemTo10X.r脚本，不知道您是否方便发一下？还有这样转换成10×格式后会在分析上面产生一些报错吗？

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ParaAT批量比对出现问题，这个是怎么回事？

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泛基因家族分析数据准备

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请问，基因完整序列位置是在gff注释文件中寻找吗？如下基因AUR62002649的基因位置在Chr03的44543929到44575315？相当于这个基因有31386个碱基长度？

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cytoscape没有layout

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进行ka ks分析报错

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circos绘图

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5 进行宏基因组分析组装这一部分，比对 reads，生成未比对 BAM 文件时很慢

  • 2025-10-10 20:38
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运行MCScanX查找共线性，java绘图出现错误为什么？