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您好iqtree2运行的时候报错，“You should increase checkpoint interval from the default 60 seconds”，请问可能是什么问题呢？docker虚拟机CPU：16 core，Memory：64 GB。谢谢！

  • 2025-07-05 22:26
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我让生物公司测一个莱甲的基因组，挂载的时候他们挂载6条染色体，但是我核型检测是13对染色体，挂13个的hic热图效果不如挂6个的图好，这种情况怎么处理呢

  • Nier 2025-09-07 10:21
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老师，cellranger count 报错：job failed in stage code怎么解决

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共线性分析，我看文献有说共线区块，我可以通过什么命令来计数？

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omicsclass/ampliseq-q1这个镜像没有了吗

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泛基因家族分析

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老师我一个一个步骤进行，一个基因一个基因分析，是这个命令有问题才出现domain_final.bed只有一个基因，代码有问题么:grep -v '#' ZS11.v10.FAE1_hmmerOut.final.txt|awk 'BEGIN{OFS="\t"}$10==1 {print $1,$18,$19 }' >ZS11.v10.domain_final.bed,这是我刚刚使用的这步的代码，前一步产生的hmmerOut.final.txt文件还整常

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string数据库

  • 2025-05-28 09:09
1 解决

蛋白3D结构预测

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我的fasta文件是由scaffold组成的，不是直接的A01和C01之类的，然后我现在用现有的文件以Gapit方式跑曼哈顿图时报错，该怎么调整

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我在STRING数据库找不到我的物种

  • 2025-05-26 21:02
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10 基因家族只有2个基因，可以做共线性分析吗，想检测一下有无复制基因对

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您好，请问在docker镜像中运行sed -i 's/transcript://' 文件名，报错sed: cannot rename ./sed2GGE7g: Input/output error是什么原因呢？在单位集群中同样的命令执行同一文件，没有报错。多谢！

  • 2025-07-05 22:21
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蛋白3D结构预测

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ALLHIC1挂载出现问题

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蛋白3D结构预测

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老师您好，进行比较基因组分析时候，在第一步数据处理，保留编码蛋白基因，及最长转录本时，出现报错，这个对后续分析有影响嘛

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蛋白互作，该下载哪一个结果txt文件。

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老师你好。提取cds与pep序列报错显示 no sequence

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老师，您好！请问做全基因组选择（GS选择）之前，训练集和预测集的划分，有没有代码可以按照特定比例，随机快速实现材料的划分，并生成文件？（比如20%个体作为训练集，80%个体作为预测集；40%个体作为训练集，60%个体作为预测集；60%个体作为训练集，40%个体作为预测集；80%个体作为训练集，20%个体作为预测集，等等）

  • 2025-08-08 16:14