10 选择非冗余基因模板的自比对,pangene与pangene两个文件进行共线性分析,时间太长应该怎么办?

输入命令‘nohup python3 -m jcvi.compara.catalog ortholog pangene pangene --cpus 5 --no_strip_names --cscore 0.99 > output.log 2>&1 &

’后,截图如下:

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从6月2号起,就不动了,已经运行了6天,没有报错,请问该怎么办?
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最佳答案 4天前

通过“ps -xf”命令查看进程的状态,麻烦老师再帮我看看。应该怎么办

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其它 1 个回答

rzx

看看生成的中间文件大小有没有增长,或者通过“ps -xf”命令查看进程的状态,参考笔记:https://www.omicsclass.com/article/483
如果是终止状态的话只能杀死进程重新运行:先删除中间文件,再修改参数--cpus 1,--batch 1000 ,或者先用小数据测试一下。

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  • liping 提出于 5天前

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