在用GEMMA软件进行GWAS分析的时候，需要加入Q矩阵，有一个疑问。为什么这个命令中，cat ../03.STRUCTURE/admixture.4.Q|cut -d " " -f 1-3 >4.Q。用的是admixture.4.Q的结果，是跟群体结构的CV error有关吗？而且后边为什么只取了前3列，生成4.Q。是所有的都只取前3列吗？
和CV error有关系。群体分析选择的k是几这里就选择 admixture.k.Q得结果。 选择前三列不是必须的，应当是选择前 k-1 列，也就是不要最后一列。
