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5 单细胞测序进行拟时分析绘制细胞骨架图

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itol里面的控制面板control panel 找不到了

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在运行table_annovar.pl脚本的时候报错

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比较基因组构建进化树，通过seqkit进行序列合并时内存爆满导致kill

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36 泛基因家族分析之Fam_gene.list

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单细胞测序使用subset脚本提出子集，再进行拟时分析报错plot_genes_by_group

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构建泛基因列表，提取最长转录本这一步，运行几个小时之后没有结果是怎么回事？

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GWAS分析发现的问题如下：第一，过滤水稻vcf的RawData时（群体有176份），我选择的minGQ值为20（同时要移除InDel），结果得出过滤出来的SNPs数量不足1000，但是我查过一些资料，GQ值如果群体数量较少值不得小于20。请问遇到这种情况如何处理，可否将最小GQ按照课程的脚本设置为0呢。 第二，你们的GWAS课程提供的计算BLUP的脚本是否在不同物种之间通用 第三，做GWAS时，基因型填充对后续的分析有什么意义。 第四，你们GWAS课程有没有计算遗传力相关的脚本。

  • John 2025-03-12 15:37
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老师您好，针对这个问题https://www.omicsclass.com/question/7725。你们提到：你这个数据里面是不是P值有0的情况，取了对数就无穷大了，导致出问题。但是，我发现里面没有P值为0的情况，那是不是脚本gwas_manhattan_plot.r有问题呢？需要修改gwas_manhattan_plot.r脚本的什么地方才可以解决顶部只能画半圆的问题呢？还有，我发现P-Value的原始文件有NaN的情况，是什么原因呢？是否对GWAS有影响呢？

  • John 2025-03-18 15:15
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请问个人怎么才能下载到TCGA的组学，临床和WSI影像数据？

  • Sasa 2025-07-01 10:16
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IBD 计算2

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10 求助，有没有用过smudgeplot做过倍性分析的大佬，对psmudgeplot.py plot参数有疑惑，请问应该然后解决，感谢

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RNAseq有参转录组分析差异表达分析这一环节出现一些问题，ggplot版本问题

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进不去docker，镜像，虚拟机。

1 解决

Hic挂载时 K值选择

  • _He. 2025-04-23 08:48
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5 juicer 报错： Failure during chimera handling of

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lefse分析细节

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eggNOG 保留蛋白序列时提示同一 ID 被多个一级特征使用，而子特征的 Parent 属性没有得到相应更新，导致注释关系不明确的问题，该怎么解决

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老师，请问在做结构变异分析的时候找到了与VCF文件相似的多个EXCL文件，请问这种情况怎么办？将excel文件后缀改成VCF文件？

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泛基因家族分析时，泛基因集构建与家族成员分析用的镜像不同，有区别吗