2 解决

10 成功启动镜像，进入容器，把课程资料下载到本地并解压缩，为什么找不到课程资料

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泛基因家族分析-SV和表达量

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泛基因集执行命令时，由syn.txt文件到最后output.txt和final.last.gene.pair.txt文件生成时会丢失一些基因吗？我做自己的物种分析时发现丢失了一些基因，是什么原因？这正常吗

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泛基因组分析中26Pan-genes.list这个文件在自己要分析的物种中怎么生成？没有相关方法介绍

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重测序var_density.R脚本报错

  • BJFU 2025-12-05 16:42
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泛基因家族分析-互作图

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泛基因家族-结构分析

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老师，在初步查看cluster分群信息时，能否使用--cols代码，实现对某个cluster的颜色进行改变，具体代码是什么

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泛基因家族-热图

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16S课程 启动镜像（DockerDesktop）

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老师，您好！全基因组选择，利用自己的SNP数据（芯片SNP）进行基因型数据处理，beagle.27Feb25.75f.jar处理完成后，得到的imputed_snp里面没有SNP标记信息。

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20 VSCode 在 R 终端运行时终端渲染将输出结果覆盖代码行

  • rzx 2026-05-28 14:19
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xpclr

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重测序过滤

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成纤维细胞分好的亚组添加到总的组中

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执行cat ../id.txt|while read ind;do ln -s ../data/${ind}.fa.gz ./ ln -s ../data/${ind}.gff3.gz ./命令时，打开01.data_prepare文件里面的内容显示如下图所示

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PGGB泛基因组报错

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EMMAX进行GWAS分析时候出现问题

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泛基因家族分析-SV和表达量

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泛基因组运行cat ../id.txt|while read ind;do agat_sp_keep_longest_isoform.pl --gff ./${ind}.gff3 -o ./${ind}.longest_isoform.gff3命令时提醒以下情况，请问具体该怎么解决