bcftools call SNP
R语言ggplot绘图基础—密度图的绘制
RCircos包绘制简单圈图
HPA:人类蛋白图谱数据库
ggplot2包绘制了展示基因在样本中表达量与数量的柱状图
samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集,包含有许多命令,其中有index用于建立索引,使之快速访问bam文件。
SNP分析中由于基因组序列过长导致报错解决方法
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5210622/
本地电脑Eclipse中连接putty,在登录服务器之后,可以在家目录下设置工作路径链接。这样就可以在Eclipse中快速找到所需要的工作文件。如下图的20210908.KEGG.GO文件夹: 设置步骤: 在putty的...
Blast比对软件
群体进化选择消除分析
parallel -j 10 <boot.sh #并行运行
https://blog.51cto.com/wutengfei/2946943
Linux 中qr命令可以将网站链接生成一个二维码
i遗传进化
compare_stat_boxplot.r metadata中变量分组T检验比较并绘制box图
merge_metadata_genexpdata.r 在metadata中添加基因表达数据
单因素cox回归分析
multi_cox.r 多因素cox分析
network.r绘制网络图,边权重信息决定网络中边的粗细,节点的度决定节点大小,根据节点类别填充节点颜色;提取网络的最大子图,输出构成最大子图的节点并绘制子图网络。