常见的OrgDB包，方便对应物种注释

列举了19个OrgDB，物种对应的全基因组注释R包，方便根据EntreZ进行基因的注释分析等等 物种 OrgDB 按蚊（Anopheles） org.Ag.eg.db 拟南芥（Arabidopsis） org.At.tair.db 牛（Brov...

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-07-05 22:47
• 阅读 ( 20800 )

DNA SequenceLogo

快速绘制DNA Logo

• 2
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-07-05 22:39
• 阅读 ( 4445 )

R语言绘制维恩图空值NA处理

行数不同的数据读入R，批量去除NA，绘制韦恩图。

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2018-07-05 16:16
• 阅读 ( 9929 )

Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色

Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色。

• 1
• 0
• omicsgene
• 发布于 2018-07-04 12:02
• 阅读 ( 10590 )

R语言统计相同ID出现的频率并用ggplot2绘制柱状图

统计相同ID出现的频率，并用ggplot绘制柱状图；

• 1
• 0
• omicsgene
• 发布于 2018-07-01 15:46
• 阅读 ( 10102 )

R语言统计数据范围并用ggplot2绘制柱状图

R语言，按数值范围统计频次，绘制柱状图

• 3
• 0
• omicsgene
• 发布于 2018-07-01 15:33
• 阅读 ( 9938 )

百万样品GWAS解释精神疾病间的遗传关系

2018年，《Science》一篇研究论文通过对上百万例实验样品数据进行分析，揭示不同精神疾病之间享有共同的遗传变异，然而神经性疾病表现更为独立。

• 0
• 0
• omics007
• 发布于 2018-06-29 22:13
• 阅读 ( 3164 )

2018年最新SCI影响因子及中科院分区统计

2018年最新生命科学类SCI影响因子及中科院分区统计

• 0
• 0
• 红橙子
• 发布于 2018-06-29 21:51
• 阅读 ( 11857 )

perl语言——正则表达式

正则表达式(regular expression)描述了一种字符串匹配的模式，可以用来检查一个串是否含有某种子串、将匹配的子串做替换或者从某个串中取出符合某个条件的子串等。 Perl语言的正则表达式功能非...

• 0
• 0
• 安生水
• 发布于 2018-06-29 14:32
• 阅读 ( 3349 )

R处理大数据时内存out of memory的问题

R处理大数据时偶尔会出现out of memory的问题，相关解决方法： 1、memory.size()查看当前work space内存使用状况（MB） 2、memory.limit()查看当前work space运行使用内存的上限 > memo...

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-29 13:16
• 阅读 ( 4825 )

统计不同样品-生物学重复基因表达量数据合并和绘图统计

处理统计RNA-seq 表达量数据，绘制柱状图，PCA散点图，还有不同样品表达基因维恩图。

• 1
• 0
• omicsgene
• 发布于 2018-06-28 23:52
• 阅读 ( 14538 )

微生物互作网络构建教程网站--Microbial association network construction tutorial

基于微生物16s测序数据中的OTU丰度矩阵可以进行微生物互作网络构建，从而探索微生物之间的互作关系。而网络的构建方法多种多样，下面给大家推荐一个网站，Microbial association network constr...

• 1
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-28 22:18
• 阅读 ( 6477 )

转录组分析时，影响差异基因数量的因素有哪些？

     差异基因的筛选是基于统计学意义的，不能直观的通过两个数值的大小判断差异基因的是否。 首先：受测序深度的影响，有些样品的测序深度较深，可能导致该样品的readcount数值较高，做差...

• 0
• 0
• landy
• 发布于 2018-06-28 16:33
• 阅读 ( 12351 )

大数据挖掘解决老年痴呆症百年难题

大数据挖掘解决老年痴呆症的病因，可能更病毒感染有关

• 0
• 0
• microRNA
• 发布于 2018-06-28 10:12
• 阅读 ( 3854 )

Cufflinks,Stringtie 合并转录本之后，如何筛选新转录本？

GTF文件中class code 注释转录本的类型

• 0
• 0
• microRNA
• 发布于 2018-06-28 09:51
• 阅读 ( 8524 )

R 删除重复数据

R 删除重复数据的方法，包括duplicated 和unique 针对duplicated, 对向量的元素或数据框的行进行操作的时候，返回逻辑值，以下面的数据框为例：  dat   A B C D1  a b a c2  c k b d3  c k c c4...

• 0
• 0
• Daitoue
• 发布于 2018-06-27 22:00
• 阅读 ( 4880 )

搭建生信编程环境eclipse+perl+python+R（java环境）

搭建自己的生信编程环境eclipse+perl+python+R（java环境）

• 1
• 0
• omicsgene
• 发布于 2018-06-25 15:45
• 阅读 ( 6133 )

TCGA和GEO套路文章解说

利用GEO数据TCGA数据筛选疾病相关标志分子，miRNA，mRNA，lncRNA，circRNA等；

• 0
• 0
• omicsgene
• 发布于 2018-06-23 14:08
• 阅读 ( 9491 )

gdc-client 下载TCGA数据

gdc-client 下载TCGA数据

• 1
• 0
• microRNA
• 发布于 2018-06-22 16:10
• 阅读 ( 13489 )

叶绿体基因做跨物种系统发育分析

叶绿体是绿色植物进行光合作用的细胞器，具有合成蛋白质、淀粉、色素等功能，普遍存在于真核自养生物中，尤其是藻类和陆生植物，其基因组可自主遗传。

• 1
• 0
• 安生水
• 发布于 2018-06-22 16:01
• 阅读 ( 6907 )