安生水
Mapman对表达数据进行venn绘制
Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外，还可以利用软件之际对多样品数据中注释到Mapmen通路的数据进行venn图绘制。主要操作过程如下： 从Experiments导入表达数据,具体参考文章：植物...
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- Daitoue
- 发布于 2018-08-02 14:01
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Daitoue
TCGAbiolinks 下载临床数据，警惕有多次随访数据
TCGAbiolinks 下载临床数据，警惕有多次随访数据
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- microRNA
- 发布于 2018-08-01 14:04
- 阅读 ( 4831 )
microRNA
linux 从文件中随机抽取部分数据
如何从某一个文本文件中随机抽取一部分数据。譬如右下方这样的基因表达量数据的统计文件ref_trans_full_table.xls目标是由此文件中随机抽取一部分数据。 可以利用shuf获取随机数据，譬如随机...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-31 17:04
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omicsgene
Rocks集群系统(cluster)的安装与管理维护
Rocks集群系统(cluster)的安装与管理维护
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- omicsgene
- 发布于 2018-07-31 11:32
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Mapman对表达数据进行聚类分析
Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外，还可以利用软件之际对多样品数据进行聚类分析。主要操作过程如下： 从Experiments导入表达数据,具体参考文章：植物代谢通路注释+基因表达可视...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-27 10:17
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用cmd来启用软件，这样桌面就简约了
1、第一步先将软件添加到路径中 2、第二步，win+r,输入cmd,此处以QQ为例 下次直接打开这个就行了，不用点其他的了 3、在win+r界面可以经常使用小软件，如，calc等等。。。。
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- smyang2018
- 发布于 2018-07-26 22:24
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smyang2018
Python 学习（一）
1:、数值类型 整型、浮点型、布尔型、复数型 整型：1；2 浮点型：a=1.1;b=2.3 布尔型：True;False 复数型：e=1+1j 2、查看类型 令a=1 dir(a) 3、查看数据类型 4、a+=1等于a=a+1 a-=1...
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- smyang2018
- 发布于 2018-07-26 22:09
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GoMapman-几种模式植物蛋白、代谢物、sRNA关于Mapman注释查询
推荐一个Mapman 本体查询的网站：GoMapman（http://www.gomapman.org/） 网站主要涉及了蛋白、代谢物以及sRNA在Mapman注释通路的查询。通过完整可以浏览具体的通路上可能会涉及那些基因，也可...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-26 13:24
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rmvnorm函数生成随机矩阵
借助rmvnorm()生成一个多维正态随机矩阵 安装mvtnorm包 > install.packages("mvtnorm")> library(mvtnorm) 生成随机矩阵x=rmvnorm(n,mean=rep(0,nrow(sigma)),sigma=diag(length(mean)…)...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-25 11:42
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红橙子
Muscle 进行多序列比对
MUSCLE(Multiple Protein Sequence Alignment)是一款蛋白质水平多序列比对的软件，在速度和精度上都优于 ClustalW。在进行多序列比对的时候，大多数情况下可以优先使用 MUSCLE。
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- 安生水
- 发布于 2018-07-20 11:53
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