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在线GO富集分析

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-11 10:38
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biolinux安装matplotlib时报错

matplotlib安装

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-09 13:25
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网站编辑器代码块 高亮显示使用技巧:

代码高亮显示tips。

GEOquery 读取本地表达矩阵压缩包

利用GEOquery包的getGEO()可以进行芯片相关数据的下载,不过,有人反映不少芯片的表达矩阵下载经常出错,可以通过手动下载的方式将矩阵文件下载到对应的工作路径中: 矩阵文件的基本命名格式...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-06 16:00
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BLAST+使用方法

BLAST+是使用非常广泛的序列比对软件,有NCBI提供

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 14:36
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dcaps标记设计软件——SNP_Primer_Pipeline

之前在做dcaps标记,开始只找到网站版的软件,后来发现一个不错的脚本软件——SNP_Primer_Pipeline

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 14:21
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手把手教你使用GSEA分析!

准备好分析需要的文件,在GSEA官网下载分析软件(软件可以免费下载,需要配置java环境)就可以进行GSEA分析。 打开分析软件,第一步是载入数据,如下图所示,点击红箭头指向的1出的Load data会...

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  • landy
  • 发布于 2018-07-06 12:53
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TCGA中转录因子的调控分析

转录因子在TCGA中的调控分析

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-06 12:05
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TF的结合序列查找

转录因子的结合序列查找

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-06 11:07
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常见的OrgDB包,方便对应物种注释

列举了19个OrgDB,物种对应的全基因组注释R包,方便根据EntreZ进行基因的注释分析等等 物种 OrgDB 按蚊(Anopheles) org.Ag.eg.db 拟南芥(Arabidopsis) org.At.tair.db 牛(Brov...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-05 22:47
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DNA SequenceLogo

快速绘制DNA Logo

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-05 22:39
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R语言绘制维恩图空值NA处理

行数不同的数据读入R,批量去除NA,绘制韦恩图。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-05 16:16
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Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色

Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-04 12:02
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R语言统计相同ID出现的频率并用ggplot2绘制柱状图

统计相同ID出现的频率,并用ggplot绘制柱状图;

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-01 15:46
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R语言统计数据范围并用ggplot2绘制柱状图

R语言,按数值范围统计频次,绘制柱状图

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-01 15:33
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百万样品GWAS解释精神疾病间的遗传关系

2018年,《Science》一篇研究论文通过对上百万例实验样品数据进行分析,揭示不同精神疾病之间享有共同的遗传变异,然而神经性疾病表现更为独立。

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  • omics007
  • 发布于 2018-06-29 22:13
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2018年最新SCI影响因子及中科院分区统计

2018年最新生命科学类SCI影响因子及中科院分区统计

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  • 红橙子
  • 发布于 2018-06-29 21:51
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perl语言——正则表达式

正则表达式(regular expression)描述了一种字符串匹配的模式,可以用来检查一个串是否含有某种子串、将匹配的子串做替换或者从某个串中取出符合某个条件的子串等。 Perl语言的正则表达式功能非...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-29 14:32
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R处理大数据时内存out of memory的问题

R处理大数据时偶尔会出现out of memory的问题,相关解决方法: 1、memory.size()查看当前work space内存使用状况(MB) 2、memory.limit()查看当前work space运行使用内存的上限 > memo...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-29 13:16
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统计不同样品-生物学重复基因表达量数据合并和绘图统计

处理统计RNA-seq 表达量数据,绘制柱状图,PCA散点图,还有不同样品表达基因维恩图。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-28 23:52
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