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老师，请问基因家族计算Ka/Ks是用提取鉴定好的重复基因序列比对计算，还是用该家族全部CDS序列比对后计算？两个物种之间共线性的基因也是相同方法吗？

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您好，我想请教一下为什么用evolview美化进化树时，总是出现 error: error: at least one valid colorset data should be given; data not upload/ updated 这个提示呢

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老师，您好，我在进化树分析的文件格式转化的过程中遇到了问题，就是命令运行结束，ll发现没有文件出现，这里我有的不会，还请老师指点一下

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群体课程里面 得到的Fst区间 如何合并区间并计算相应的Fst值？

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群体遗传进化分析课程中，如下图所示利用run_pipeline.pl -Xmx5G -importGuess $workdir/00.filter/clean.vcf.gz \ -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter这个代码并没有在01.phylo_tree文件夹中得到supergene.phy的文件

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请问老师做PCA分析时提示Segmentation fault是什么原因，该怎么解决呢

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docker安装失败 win11系统怎么装docker

  • 2022-02-08 01:07
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docker

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有关群体pop_Group.txt的问题，最大可以分几个组，如果分组太多怎么修改脚本的颜色设置

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LDdecay

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基于SNP绘制的进化树怎么添加外类群？

  • 2022-01-12 15:31
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5 Tajima's D 计算结果出图空白。

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5 #fst 与 pi 联合 筛选受选择区域

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#Fst 群体间多样性差异 vcftools Error: Unknown option:

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pi多样性绘图输入文件有数据，但绘图空白

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docker运行中出现segmentation fault，用的示例数据

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ref 换成水稻的，群体进化计算pi #pi多样性绘图输出为空白，不知道是不是没读入fai文件

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您好，可以把单子叶植物Ka/Ks突变速率参考文献发给我一下吗？我的邮箱：1316648272@qq.com。万分感谢！

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群体遗传进化分析 W文件中的PCA代码 出现bug

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老师您好，我利用Fst、π和Tajima's D方法对2个种群的重测序数据进行了选择清楚分析，获得了候选基因，我想请问一下筛选到的基因就是受到正选择的吗？需要怎样判断哪些基因受到正选择，哪些基因受到负选择？谢谢老师！