做用于GWAS的全体的LD decay

我做了分不同群体的LD decay后,我想把所有亚群合在一起做一个LD decay来确定应取GWAS的某个显著点的多少kd(虽然老师上课说的是50/100)(就是假设总vcf文件里面是一个群体),但是就会出现报错,说attachments-2022-11-vFS8BRpq63608ddb6d8c1.png

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你再看看课程理解, LDdecay和GWAS关联的位点没关系的;

只是总体看一下群体的LD连锁情况;

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  • 昵称无限无视 提出于 2022-11-01 11:07

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