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5 老师，我在基因家族鉴定时，用新生成的hmm文件做hmmsearch时，报TC bit thresholds unavailable on model domain的错误。最开始以为是e值太高1e-5,但我后面改为1e-10还是报这个错误。请问老师是什么原因呢？

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5 RIL群体的基因型分离比例多少？构建遗传图需要多大群体？

  • 2019-05-10 09:18
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5 基因表达量的相对表达

  • 2019-05-10 01:15
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5 我在做进化树时，为撒在mega中找不到与之匹配的文件

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5 请问老师做基因染色体定位没有dna.fa文件，可以用transcript.fa文件代替吗？

  • 2019-05-09 16:09
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5 做生信的笔记本什么配置够啊？

  • 2019-05-08 21:40
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30 老师，我提的GFF文件里面的mRNA2geneID.txt与要去除冗余的基因名称不同怎么办?

  • 2019-05-08 15:54
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5 基因家族筛选

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10 老师，我用perl script/select_redundant_mRNA.pl去除冗余，结果显示在一行，是不是文件里面的对应名称错了？

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5 老师请问gff文件提前mRNA的id不是数字，是字母，是不是脚本需要换？

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5 老师，我用perl script/select_redundant_mRNA.pl去除冗余，最后生成文件没有分行，显示在一行，怎么办?

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5 MCSCAN

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5 我用MCScanX做共线性分析，染色体出现重叠现象，请问MCScanX做共线性分析限制染色体条数吗，我有22条染色体

  • 2019-05-05 08:51
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5 安装GenvisR包总是报错

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5 老师，您好，我在做序列比对时，两个在不同染色体上的不同基因CDS序列比对相似性是百分之百？抽出来看，确实是一模一样的，为什么会有这种情况呐？

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5 老师您好，请问在用MEGA软件利用保守域构建进化树时有几个基因含有不完整的结构域序列导致进化树构建不成功，删除后就可以构建了，删除的那几个基因在pfam和NCBI都确认了含有该保守结构域，后续分析的时候还可以继续将其归为该基因家族成员吗？

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5 在用tbtools计算基因对的KAKS时，出现了KS值大于1的情况，这种情况是正常的吗？KS取值范围是0~1吗？

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5 鲁棒性检验代码

  • 2019-04-30 00:20
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5 做基因家族成员鉴定时，如何从NCBI数据库里下载转录组unigene的蛋白质序列文件？

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5 mafft可以批量多序列比对吗