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提取蛋白序列报错

  • 荣 2021-01-13 21:26
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10 老师，您好，我在16S数据实操中的qiime聚类生成otu的三个方法中，都出现了运算中断的问题，不知道哪里出错了，在挨个进算的时候发现图中的这步运行有问题，老师您看看是哪里出错了(╥_╥)

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关于VirtualBox中biolinux挂载共享文件夹的问题

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在基因家族分析过程中，确定结构域的时候发现一个算是该基因超家族但不是该基因家族的成员，那这个算是该基因家族的成员吗

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老师好，想问下将蛋白质序列提交的MEME在线软件后，几天后为什么没有结果啊?显示工作已完成，却没有结果，谢谢

  • ljx 2021-01-11 12:46
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5 基因家族分析

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您好，老师，我这段代码想实现个循环，可只输入fd文件的第一个数据，就输出了，实现不了循环，麻烦老师给指导一下，谢谢老师

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老师，您好，我在16S数据实操中的qiime聚类生成otu的第一个方法中操作 pick_de_novo_otus.py 这一步，缺少了很多文件，之后我又单独操作的，在操作第三步 # Assign taxonomy command 时，没有出现qiime_rep_set_tax_assignments.txt 这个文件，第四步也没有办法操作，是哪里出问题了呢

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比较基因组学分析时报错，无法生成 anchors文件

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脚本参数--minsize=0 --minspan=30

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重复文章代码出错

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老师你好，麻烦请教一下用dCAPS Finfer2.0网页，如何设计dCAPS标记，有引入1个错配还有2个错配的，不知道选哪个合适。

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老师，请问domain BED 文件的位置信息如何获得？

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如果利用基因来批量提取一批基因的蛋白序列，结果提取的结构域文件中，发现并不是全部的基因都提取出了序列，那么怎么查找或者说获取这些没有提取到序列的基因是那些

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有了基因的ID后，如何批量获取这些基因的染色体所在，以及这些基因的起始位置

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5 想问一下大家做蛋白质谱搜库分析的时候用maxquant我原始文件是wife.scan格式的不是raw格式的用此软件可以吗，因为看到在选项里面是有wiff的，但是我发现最后性能那里不能得到结果，显示报错，想问有没有大神可以解答一下呀多谢多谢

  • 2021-01-03 19:03
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请问如果在染色体定位中发现一对串联重复基因位于不同的两条染色体上，这说明什么？？可以说明他们的复制方式是串联重复还是片段重复吗？？

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5 请问基因家族中串联重复基因的KAKS 数值在哪看？？有表示出来吗？？这一步的意义是什么

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5 老师您好，文件共享挂载出现错误应该怎么解决呢？

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基因家族分析，用CDD确认结构域的时候，根据统计的表格，怎么找到那些未匹配到相应结构域的基因或者序列是哪个？