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老师好,在基因家族分析课程视频里,鉴定基因家族成员时,里面实操用的是基因组的蛋白质序列(pep文件),然而我自己的实验数据是无参转录组,我想问下,我应该用什么文件来鉴定基因家族成员呢?我看到之前有类似问题的答案是unigene或者蛋白质序列,两者有什么区别呢?
旗旗
2019-01-11 16:53
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我用CIRCOS画图,文字标签叠加了要怎么弄到同一水平?
2019-01-09 17:12
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利用蛋白ID获取基因ID时 所获得文件少一列
。翟
2019-01-09 16:59
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5
关于基因家族中的串联重复基因的删选、Ka/Ks的计算、串联重复基因Circose图的分析有相关的文献吗?
KaKs
Circos
串联重复
Sunny
2019-01-09 10:13
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5
基因家族成员如何取舍,命名?如何查找外显子和内含子结构?
基因家族
周大丽
2018-12-28 14:12
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基因家族分析 hmmer 第四讲
苏杨
2018-12-27 12:05
1
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5
绘制circos提示错误
yupeng
2018-12-22 11:24
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5
问一下老师 做基因家族分析 用新生成的hmm文件做hmmsearch 报 TC bit thresholds unavailable的错
.、
2018-12-20 11:37
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5
麻烦求助,在使用ncbi_gff_2_Ensembl_gff.pl这个脚本的时出现报错显示:cant find the string terminator "Usage end"...in line 10
wilson D
2018-12-17 16:05
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5
老师,我想问一下,我在预测顺式作用元件时,在提取出来的基因上游1500bp的文件中,有的基因是这样的
小不点
2018-12-17 12:53
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5
用ncbi搜索pfam号 为什么没有 出来的是pmid 怎么办 文章也没有pfam号
pfam
Mt kiki
2018-12-17 11:43
2
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MCScanX family_circle_plotter 运行错误
MCScanX
槐序
2018-12-14 22:08
3
回答
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5
利用hmmer软件鉴定基因家族成员,用的1e-20搜索,没有找到相应的domain
hmmer
*雪狐*
2018-12-12 16:01
1
解决
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5
老师好,通过拟南芥蛋白序列获得的隐马尔科夫模型文件可以用在别的物种上吗?
隐马尔科夫模型
yupeng
2018-12-12 15:44
1
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meme中motif site和scanned site
王莉
2018-12-12 09:36
1
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5
基因加倍与串联重复分析
blastall
luoluo
2018-12-10 16:07
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5
老师您好,我有些问题想请教您。我在Biolnux系统上安装MCScanX时,到使用make命令时就出现了错误,应该怎么办呢
小不点
2018-12-02 12:27
2
回答
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5
如何分析某个基因家族内的(假设只有15个基因)tandem duplication和segmental duplication事件?
cookies12
2018-12-01 22:23
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解决
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基因的共线性分析
MCScanX
cookies12
2018-12-01 22:18
1
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老师您好!请问怎么在mapchart画连锁图时加标尺
QTL连锁图
2018-11-28 20:13
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