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老师您好，在参考基因组比对时出错。

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拟时分析筛选出的差异基因数量太少，有没有可以调整的参数去增加筛选数量

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老师，我在构建泛基因列表时，做cat pangene_filter.*lifted.anchors | grep -v "^#" | awk '{print $1"\t"$2}'> ../03.jcvi-pan-vs-genome/syn.txt这一步，找不到pangene_filter.*lifted.anchors 是怎么回事

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[main] unrecognized preset 'china-wild-ibex-clean.recode.vcf.gz'

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gatk GenomicsDBImport

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10 大家好，我想问一下，做进化树分析，想把一些文件从一个文件夹cp到新建的进化树的文件夹，但是cp的时候说找不到这些文件，但这些文件就在哪里，不知道这是什么原因呢，直接复制粘贴过去也不太行，在终端里ll一下依旧找不到。

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5 gatk变异检测

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windows10安装docker后，输入命令，报错，请问如何解决？

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如何下载别人的重测序数据

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tgsgapcloser报错

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我在做T2T，docker下载T2T镜像错误

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泛基因家族鉴定-找不到Bio::SeqIO模块

  • Q_C 2025-04-16 13:28
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老师，我在做dadi分析的时候，发现没有代码里显示的easySFS.py的脚本，给的文件里也没有，就一直报错

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3 老师，在泛基因列表构建时，总共113个基因组，成功提取了最长转录本，提取bed文件，但提取cds文件时，有一个文件A10总是失败，不知道什么原因。

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泛基因家族，典型基因和非典型基因的热图怎么做？

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基因家族分析，最长转录本，复制的命令，还是报错。咋整

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请问可以同时运行2个terminal吗，在内存和存储还有cpu都有剩余很多的情况下

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根据没有标识转录本是1还是2或3的IDlist基因号名单，在标识了转录本的蛋白质序列文件中搜索，可以把IDlist名单中的所有转录本蛋白序列搜索出来吗？可以改命令达成？这是我的命令seqkit grep -f Nramp_IDlist_final.txt arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.CCJH.protein.faa -o Nramp_pep_final.fa 我把IDlist里面名单后面都加了转录本号才搜出来。？

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后台运行

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基因家族结构分析，为什么会出现下图图形盖住基因名的情况，怎样可以改正呢