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空间转录组saw count 运行到register时报错
空间转录组
glucose
2025-12-22 11:22
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Tassel表型文件和基因组文件样本量不一样
peanut2025
2025-11-13 17:02
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泛基因家族分析数据准备里面,运行命令保留最长转录本结果都会报错,说是找不到文件,但文件存在在data目录下, ./.gff3.gz does not exist,Please verify the input file name/path
泛基因家族分析
杨辉
2025-10-30 19:01
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在KEGG通路中(植物激素信号转导),我只关注这个通路下的几个基因(赤霉素有关),那么他的gene.ratio和p_value也要变化吗,以及如何计算
2025-11-25 09:06
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单细胞测序cellranger分析
cellranger
幽篁陌语
2025-11-07 18:58
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可能是路径出了问题,无法找到脚本,请问老师
软件工具
Ma Chengming
2025-11-28 23:28
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老师请问一下我在做hic挂载练习的时候运行到使用bwa的aln和sampe进行比对,这里问什么不运用mem这个功能进行比对呢
Nier
2025-10-17 16:36
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泛基因家族分析的数据准备的里面有一个加载全局变量env.sh,请问这个有什么作用?里面改没改这个Ref=B73为自己的物种有什么区别呢,修改了要不要加这个基因组的具体路径?
泛基因组家族分析
杨辉
2025-10-30 18:37
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你好老师为什么这里无法启动镜像
Nier
2025-12-27 18:23
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你好,请问你当时提出的那个问题解决了吗,我现在也是卡在这一步了,求指教
2025-12-18 16:02
0
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在全基因组选择育种课程中,所有需要预测的样本(在 pred_ID.csv 中列出的ID),必须已经存在于那个巨大的基因型文件 imputed_snp.raw 中,是否就意味着我只能预测现有群体的缺失部分?我需要预测新的群体,那这 pred_ID.csv文件该如何编写?
陈帮鑫
2025-09-09 11:08
1
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重测序过滤
Androsace
2026-01-06 15:24
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叶绿体比较基因组分析你好,我组装好的Fasta文件是一条一条的,课程里重复序列和多态性分析用的示例文件是总all.fasta,我需要怎么能整合起来,一条条好像也分析不成
媛缘圆
2025-11-21 09:02
0
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泛基因家族分析PAV_gene.list中基因数量,少于gene.pep.fa中序列的数目
中华鲟
2025-10-13 19:15
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在PAV分析绘制热图的时候,运行R脚本出现如下错误,请问怎么解决?这个aplot安装包安装也一直安装不了
泛基因家族分析
杨辉
2025-11-11 19:38
1
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在基因组注释部分有一条命令RepeatMaskerLib=/share/work/biosoft/RepeatMasker/RepeatMasker/Libraries/RepeatMaskerLib.h5用来指定RepeatMaskerLib所在位置,那这里如果是要在自己的电脑上跑的话这里路径变量应该在哪呢
Nier
2025-12-25 12:20
1
回答
433
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在用GEMMA软件进行GWAS分析的时候,需要加入Q矩阵,有一个疑问
GWAS
郭老师
2026-01-04 11:04
0
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用iqtree对SNP构建系统进化树出现提示
人生若只如初见
2025-11-07 15:04
1
回答
427
浏览
EMMAX进行GWAS分析时候出现问题
emmax
郭老师
2025-12-29 11:47
1
回答
427
浏览
老师,您好!在变异结果注释ANNOVAR这部分里面,结果出现报错。如何解决?
变异结果注释
段宇杰
2025-11-19 18:03
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