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重复序列分析

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基于图形泛基因组文件call取sv的时候，运行命令nohup vg call new_index.giraffe.gbz -r new_index.snarls -k D23.pack -a -A -t 30 -s D23 > D23.vcf 2>call.o &，显示done，但生成的vcf文件里面没有变异位点，只有个头，如截图中所示。这种问题怎么解决呢？

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连接镜像被拒绝

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老师您好，基因家族鉴定的时候，要求使用 GA 阈值重新运行 hmmsearch 分析保守结构域。请问这个GA阈值是什么啊，应该怎么操作呢

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但我后面加了$之后它先是报错没有index目录，创建之后运行不报错但没有运行结果

  • xxx 2026-01-06 14:41
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10 您好，请问SNPT软件失效了

  • cc 2025-12-31 16:09
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建立索引时出现报错，但依旧出现了一些文件，想问问报错原因怎么处理

  • xxx 2026-01-07 15:24
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老师，我想把镜像复制到自己服务器上使用，使用的是singularity run reseq.sif，为何进入容器以后软件都用不了呢，是哪里出了问题？

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泛基因家族分析，核心基因等数量统计

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今天下午docker突然不能用了是什么原因？？

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下图的文件是怎么得到的

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5 课程咨询

  • 2026-01-17 16:14
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老师我已经把压缩包cat到一起并且更改了容器的名字为什么还是不行上一个问题的链接在这里因为无法在上个问题继续放上图片https://www.omicsclass.com/question/8300

  • Nier 2026-01-20 18:57
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想知道sh scriptdir/index.sh怎么创建才能用于索引建立，输入指令显示不存在

  • xxx 2026-01-06 10:38
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hmmsearch运行时异常终止

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docker 安装

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为什么这两次是一个文件，只是改变了核数，输出的结果却不一样了

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泛基因组

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docker 导入镜像

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泛基因家族做完PAV分析后，发现有的物种没有任何一个基因